More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0559 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  73.82 
 
 		 193 aa  288  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  69.19 
 
 		 200 aa  274  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  67.02 
 
 		 199 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  68.06 
 
 		 199 aa  268  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  67.71 
 
 		 195 aa  257  8e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  64.4 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  62.57 
 
 		 200 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  63.54 
 
 		 192 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  65.1 
 
 		 309 aa  247  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  61.98 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  61.26 
 
 		 200 aa  245  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  60.21 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  60.21 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  59.69 
 
 		 194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  62.3 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  63.35 
 
 		 360 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  62.83 
 
 		 341 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  64.4 
 
 		 367 aa  237  9e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  60.42 
 
 		 194 aa  234  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  63.02 
 
 		 335 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  57.59 
 
 		 205 aa  228  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  60.1 
 
 		 205 aa  219  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  57.59 
 
 		 192 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  57.07 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  54.69 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  50.93 
 
 		 216 aa  207  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  49.07 
 
 		 216 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  51.52 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  49.07 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  48.11 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  48.82 
 
 		 227 aa  194  7e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  50.81 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  46.95 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  50.26 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  48.11 
 
 		 214 aa  188  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  46.19 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  46.19 
 
 		 229 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  52.33 
 
 		 181 aa  185  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  45.67 
 
 		 217 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  48.6 
 
 		 216 aa  184  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  47.89 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  45.71 
 
 		 229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  48.44 
 
 		 189 aa  181  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  50.27 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  44.93 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  45.28 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  49.74 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  47.62 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  43.66 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  45.28 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  47.18 
 
 		 190 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  48.44 
 
 		 187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  48.22 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  46.01 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  48.17 
 
 		 191 aa  178  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  46.01 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  45.02 
 
 		 217 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  47.2 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.92 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  44.59 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  46.88 
 
 		 204 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  43.81 
 
 		 423 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  44.6 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  45.07 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  46.04 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  42.08 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  41.63 
 
 		 211 aa  175  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  46.6 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  44.74 
 
 		 192 aa  175  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  45.07 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  44.88 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  44.5 
 
 		 219 aa  174  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  42.92 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05122  Adenylate kinase 1 (AK 1)(EC 2.7.4.3)(ATP-AMP transphosphorylase 1)(Adenylate kinase cytosolic and mitochondrial) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V8]  46.19 
 
 		 259 aa  174  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  46.81 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  42.72 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  44.08 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  43.4 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  42.66 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  42.27 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  46.07 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  42.47 
 
 		 215 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  45.37 
 
 		 217 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  44.39 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  41.1 
 
 		 215 aa  171  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  45.9 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  46.6 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  43.66 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  47.4 
 
 		 213 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  41.63 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  41.63 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  44.21 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.71 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  42.01 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0949  adenylate kinase  47.34 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.675303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  44.39 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  45.55 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  45.55 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  47.37 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>