More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1007 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  80.1 
 
 		 194 aa  312  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  80.1 
 
 		 194 aa  312  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  79.58 
 
 		 194 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  68.06 
 
 		 193 aa  255  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  63.35 
 
 		 192 aa  251  6e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  63.54 
 
 		 193 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  66.67 
 
 		 194 aa  247  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  64.06 
 
 		 199 aa  245  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  62.83 
 
 		 200 aa  239  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  61.78 
 
 		 206 aa  233  9e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  60.21 
 
 		 199 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  60.42 
 
 		 309 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  60.94 
 
 		 195 aa  228  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  59.69 
 
 		 208 aa  227  6e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  59.16 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  59.16 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  60.21 
 
 		 360 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  61.26 
 
 		 367 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  55.56 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  59.69 
 
 		 341 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  54.63 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  57.59 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  57.81 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  56.54 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  60.42 
 
 		 335 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  52.78 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  58.12 
 
 		 205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  54.69 
 
 		 192 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  50.7 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  53.27 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  52.08 
 
 		 189 aa  195  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  49.77 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  47.42 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  50 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  45.28 
 
 		 220 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  47.39 
 
 		 227 aa  184  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  51.34 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  49.52 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  45.02 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  46.95 
 
 		 222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  45.58 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  47.64 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  46.15 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  47.49 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  47.92 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  50 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  45.67 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  47.49 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0815  adenylate kinase  46.61 
 
 		 215 aa  174  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  45.67 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  48.91 
 
 		 189 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  45.12 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  47.89 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  45.12 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  50 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.44 
 
 		 423 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  45.67 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  45.91 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  41.04 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  44.55 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  46.95 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  42.72 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  46.52 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  46.48 
 
 		 217 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  42.79 
 
 		 213 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  42.25 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  45.19 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  47.85 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  45.67 
 
 		 213 aa  171  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  46.48 
 
 		 229 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  48.92 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  44.55 
 
 		 214 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  46.19 
 
 		 214 aa  170  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  47.39 
 
 		 229 aa  170  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  50.81 
 
 		 204 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  41.51 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  42.73 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  44.86 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  45.07 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  47.67 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  42.99 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  43.19 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37399  predicted protein  42.6 
 
 		 239 aa  169  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.889133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  44.09 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  43.46 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.6 
 
 		 211 aa  168  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  48.17 
 
 		 191 aa  168  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  43.24 
 
 		 216 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  43.26 
 
 		 218 aa  167  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  43.64 
 
 		 234 aa  167  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  43.12 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  44.65 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  47.57 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  44.13 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  47.57 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  47.57 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  43.64 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  47.06 
 
 		 188 aa  167  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  45.45 
 
 		 214 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>