More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1375 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  73.82 
 
 		 193 aa  288  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  71.88 
 
 		 200 aa  274  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  67.71 
 
 		 200 aa  263  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  68.06 
 
 		 200 aa  263  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  67.54 
 
 		 200 aa  263  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  68.23 
 
 		 199 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  65.97 
 
 		 199 aa  254  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  68.06 
 
 		 192 aa  255  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  66.49 
 
 		 195 aa  252  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  65.28 
 
 		 309 aa  247  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  63.87 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  63.87 
 
 		 194 aa  244  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  63.87 
 
 		 194 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  62.5 
 
 		 206 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  64.92 
 
 		 194 aa  238  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  62.69 
 
 		 341 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  62.18 
 
 		 360 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  59.9 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  62.18 
 
 		 367 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  58.33 
 
 		 192 aa  225  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  62.18 
 
 		 335 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  61.26 
 
 		 205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  56.02 
 
 		 192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  57.37 
 
 		 195 aa  214  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  57.51 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  51.16 
 
 		 216 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  51.16 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  51.16 
 
 		 216 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  50 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  50 
 
 		 216 aa  189  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  51.83 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  50.7 
 
 		 216 aa  187  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  45.75 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  50.8 
 
 		 187 aa  184  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  50.27 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  48.11 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  49.74 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  45.33 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  45.75 
 
 		 213 aa  181  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  48.37 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.95 
 
 		 423 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  44.6 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  48.83 
 
 		 219 aa  178  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  49.3 
 
 		 215 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  43.93 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  44.34 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  46.41 
 
 		 217 aa  175  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  47.89 
 
 		 229 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  47.89 
 
 		 217 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  47.42 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  46.27 
 
 		 214 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  44.44 
 
 		 213 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  47.83 
 
 		 189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  48.78 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  45.37 
 
 		 217 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  44.65 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  44.86 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  45.07 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  44.65 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  44.39 
 
 		 214 aa  170  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  42.79 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.06 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.23 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  44.79 
 
 		 192 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  48.92 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  47.06 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  47.12 
 
 		 191 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  42.92 
 
 		 216 aa  168  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  41.59 
 
 		 221 aa  168  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  42.04 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  44.27 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  46.45 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  47.57 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  41.63 
 
 		 222 aa  167  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  46.84 
 
 		 193 aa  167  7e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  45.63 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  48.19 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  42.65 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  44.88 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  45.58 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  41.63 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  43.14 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  43.48 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  45.83 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  47.06 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  42.45 
 
 		 215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  42.78 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  45.41 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  45.16 
 
 		 184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  47.34 
 
 		 218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  45.41 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  45.41 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  45.41 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  41.98 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  41.98 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  41.83 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  43.9 
 
 		 217 aa  161  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  42.92 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  42.78 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>