More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1718 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  100 
 
 
213 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  78.87 
 
 
213 aa  352  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  70.42 
 
 
214 aa  320  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  68.87 
 
 
214 aa  310  7.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  63.38 
 
 
217 aa  291  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  62.26 
 
 
215 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  62.98 
 
 
216 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  60.29 
 
 
215 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  60.29 
 
 
215 aa  280  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  62.74 
 
 
216 aa  280  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  62.74 
 
 
216 aa  279  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  62.74 
 
 
216 aa  279  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  62.74 
 
 
216 aa  279  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  62.74 
 
 
216 aa  279  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  62.26 
 
 
216 aa  278  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  61.54 
 
 
217 aa  278  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  62.26 
 
 
216 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  62.26 
 
 
216 aa  276  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  62.26 
 
 
216 aa  276  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  62.26 
 
 
216 aa  276  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  62.26 
 
 
216 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  57.42 
 
 
215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  58.22 
 
 
214 aa  266  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  59.02 
 
 
217 aa  265  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  57.21 
 
 
213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  54.72 
 
 
217 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  60.48 
 
 
215 aa  258  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  54.33 
 
 
215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  55.4 
 
 
214 aa  257  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  54.81 
 
 
215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  54.46 
 
 
214 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  54.72 
 
 
216 aa  250  9.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  55.34 
 
 
211 aa  250  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  54.72 
 
 
216 aa  248  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  56.07 
 
 
218 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  52.58 
 
 
215 aa  246  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  54.81 
 
 
215 aa  246  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  55.19 
 
 
217 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  55.98 
 
 
219 aa  245  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  53.11 
 
 
217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  51.64 
 
 
217 aa  244  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  54.81 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  54.81 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  51.64 
 
 
217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  51.92 
 
 
216 aa  236  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  54.59 
 
 
217 aa  235  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  51.67 
 
 
217 aa  234  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.58 
 
 
222 aa  232  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  53.57 
 
 
217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  50.94 
 
 
214 aa  231  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  51.78 
 
 
217 aa  231  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.11 
 
 
226 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  49.3 
 
 
217 aa  228  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  49.3 
 
 
217 aa  228  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.11 
 
 
226 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  51.44 
 
 
222 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  53.33 
 
 
219 aa  226  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  50.96 
 
 
208 aa  224  7e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0079  adenylate kinase  52.63 
 
 
212 aa  222  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000187867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  48.33 
 
 
217 aa  222  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  50.48 
 
 
215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  49.52 
 
 
213 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  48.08 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  50 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.71 
 
 
423 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  52.55 
 
 
217 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  51.6 
 
 
215 aa  218  7.999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  48.83 
 
 
216 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3974  adenylate kinase  52.15 
 
 
210 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  48.18 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  46.95 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  51.78 
 
 
209 aa  215  5e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  47.06 
 
 
219 aa  214  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  50.48 
 
 
208 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  48.78 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  47.83 
 
 
227 aa  213  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  48.11 
 
 
217 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  48.08 
 
 
208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  55.08 
 
 
215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  45.91 
 
 
218 aa  211  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  46.63 
 
 
224 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  47.93 
 
 
214 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  50.24 
 
 
220 aa  209  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  48.8 
 
 
214 aa  209  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  50.24 
 
 
220 aa  209  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  47.66 
 
 
224 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  45.71 
 
 
219 aa  207  8e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  47.32 
 
 
229 aa  207  8e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  48.51 
 
 
222 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  46.73 
 
 
217 aa  207  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  46.54 
 
 
214 aa  206  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  48.45 
 
 
221 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  48.83 
 
 
213 aa  206  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  50.8 
 
 
218 aa  206  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  48.8 
 
 
214 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_437  adenylate kinase  48.58 
 
 
216 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000304823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  52.69 
 
 
214 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  46.33 
 
 
214 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  44.86 
 
 
228 aa  206  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>