More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1112 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  100 
 
 
209 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  53.89 
 
 
215 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  53.03 
 
 
217 aa  223  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  55.22 
 
 
215 aa  221  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  47.85 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  50.73 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  49.28 
 
 
216 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  49.52 
 
 
216 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  48.54 
 
 
217 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  48.13 
 
 
217 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  51.78 
 
 
215 aa  217  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  51.78 
 
 
215 aa  217  7.999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  50.24 
 
 
218 aa  216  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  51.78 
 
 
213 aa  215  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  48.1 
 
 
216 aa  214  7e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  48.06 
 
 
215 aa  214  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  50.97 
 
 
213 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  47.62 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  47.62 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  47.62 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  47.62 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  47.62 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  47.62 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  47.62 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  50.25 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  48.1 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  47.62 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  47.55 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  49.02 
 
 
214 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  47.6 
 
 
228 aa  211  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  50.76 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  47.69 
 
 
216 aa  211  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  48.33 
 
 
222 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  48.22 
 
 
217 aa  210  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  48.73 
 
 
217 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.15 
 
 
217 aa  208  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  46.63 
 
 
216 aa  208  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  46.63 
 
 
216 aa  208  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  47.29 
 
 
214 aa  208  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  48.53 
 
 
220 aa  208  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  49.28 
 
 
215 aa  207  7e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  50.26 
 
 
214 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  46.7 
 
 
217 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  45.45 
 
 
211 aa  205  3e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  48.72 
 
 
217 aa  205  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  55.43 
 
 
214 aa  204  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  45.45 
 
 
216 aa  204  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  50.76 
 
 
216 aa  204  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  49.24 
 
 
213 aa  203  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  52.97 
 
 
214 aa  202  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  48.22 
 
 
214 aa  202  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  52.43 
 
 
214 aa  202  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  50.81 
 
 
214 aa  202  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  54.35 
 
 
214 aa  201  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  54.35 
 
 
214 aa  201  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  54.4 
 
 
214 aa  201  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  44.39 
 
 
217 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  45.93 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  51.89 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  54.35 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  54.35 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  54.35 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  53.8 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  53.8 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  53.8 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1416  adenylate kinase  53.55 
 
 
219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  51.35 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  53.8 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  53.3 
 
 
214 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  51.89 
 
 
214 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  52.75 
 
 
222 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  45.02 
 
 
216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  53.26 
 
 
214 aa  198  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  50.53 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  44.34 
 
 
215 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3900  adenylate kinase  49.27 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  46.57 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  53.09 
 
 
211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1168  adenylate kinase  51.31 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.949155  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  47.09 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  47.06 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  52.17 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  52.75 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  52.75 
 
 
227 aa  195  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  52.72 
 
 
214 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  48.45 
 
 
214 aa  195  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  46.19 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1739  adenylate kinases  55.14 
 
 
218 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000022686  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  53.51 
 
 
218 aa  195  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  50.54 
 
 
217 aa  194  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  46.67 
 
 
216 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  53.3 
 
 
218 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  51.89 
 
 
214 aa  194  9e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  53.51 
 
 
218 aa  193  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  46.77 
 
 
218 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  45.59 
 
 
216 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  49.73 
 
 
214 aa  193  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.77 
 
 
220 aa  193  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>