More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1416 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1416  adenylate kinase  100 
 
 
219 aa  448  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1541  adenylate kinase  76.15 
 
 
218 aa  345  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0259287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1168  adenylate kinase  71.56 
 
 
218 aa  339  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.949155  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1510  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  73.15 
 
 
218 aa  325  3e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0949  adenylate kinase  72.94 
 
 
220 aa  322  3e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.675303 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  70.37 
 
 
218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0827  adenylate kinase  68.35 
 
 
218 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.117241  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  68.18 
 
 
222 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  69.41 
 
 
220 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  67.57 
 
 
222 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  67.73 
 
 
222 aa  310  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  67.73 
 
 
221 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  67.89 
 
 
218 aa  308  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  67.89 
 
 
218 aa  308  2.9999999999999997e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  68.95 
 
 
220 aa  308  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  67.73 
 
 
221 aa  308  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  66.36 
 
 
221 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  67.73 
 
 
221 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  68.52 
 
 
219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  68.49 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  68.49 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  68.49 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  68.49 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  68.49 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  68.49 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  68.49 
 
 
220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  68.04 
 
 
220 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  68.04 
 
 
220 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  68.04 
 
 
220 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  67.58 
 
 
220 aa  304  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  69.59 
 
 
218 aa  304  6e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  67.58 
 
 
220 aa  304  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  66.67 
 
 
217 aa  304  7e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  67.58 
 
 
220 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  66.06 
 
 
218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  66.51 
 
 
218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  67.59 
 
 
222 aa  301  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  66.51 
 
 
218 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  64.35 
 
 
217 aa  299  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  66.06 
 
 
218 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  68.98 
 
 
218 aa  298  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  66.67 
 
 
218 aa  297  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  65.74 
 
 
217 aa  296  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  67.59 
 
 
217 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  65.45 
 
 
221 aa  295  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  64.81 
 
 
217 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  64.52 
 
 
216 aa  294  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  64.52 
 
 
216 aa  294  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0309  adenylate kinase  64.55 
 
 
221 aa  292  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  64.35 
 
 
214 aa  291  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  63.59 
 
 
216 aa  290  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  63.59 
 
 
216 aa  290  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  68.52 
 
 
217 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  65.9 
 
 
218 aa  288  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  62.04 
 
 
218 aa  288  3e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  66.36 
 
 
218 aa  288  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  65.74 
 
 
218 aa  288  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1366  adenylate kinase  61.47 
 
 
218 aa  286  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  64.09 
 
 
221 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  65.9 
 
 
214 aa  286  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1362  adenylate kinase  61.01 
 
 
218 aa  285  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  63.76 
 
 
219 aa  285  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  64.06 
 
 
215 aa  284  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  284  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  284  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  284  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  284  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  63.13 
 
 
215 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  62.04 
 
 
218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  64.35 
 
 
214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  62.04 
 
 
218 aa  281  5.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  280  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  280  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  65.28 
 
 
214 aa  280  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  64.06 
 
 
214 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  61.75 
 
 
215 aa  279  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  62.96 
 
 
215 aa  279  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  61.75 
 
 
215 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  63.13 
 
 
227 aa  278  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  61.57 
 
 
215 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  63.13 
 
 
214 aa  275  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  60.83 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  63.38 
 
 
214 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0741  adenylate kinase  60.66 
 
 
212 aa  272  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0160086  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1620  adenylate kinase  62.39 
 
 
231 aa  271  6e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000794583  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0563  adenylate kinase  62.39 
 
 
231 aa  271  6e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000013335  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  63.46 
 
 
214 aa  270  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1739  adenylate kinases  58.8 
 
 
218 aa  265  4e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000022686  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  62.98 
 
 
214 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1557  adenylate kinase  57.8 
 
 
218 aa  264  7e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000621346  normal  0.163414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  59.26 
 
 
214 aa  264  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  61.29 
 
 
214 aa  264  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  57.41 
 
 
215 aa  262  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  60.37 
 
 
214 aa  261  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0373  adenylate kinase  60.56 
 
 
220 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  61.54 
 
 
214 aa  261  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  62.5 
 
 
214 aa  260  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>