More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1864 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  79.63 
 
 		 216 aa  357  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  78.7 
 
 		 216 aa  349  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  58.69 
 
 		 224 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  55.56 
 
 		 219 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  58.69 
 
 		 217 aa  255  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  55.61 
 
 		 216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  57.01 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  56.81 
 
 		 218 aa  251  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  57.28 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  57.28 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  57.08 
 
 		 227 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  54.93 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  55.4 
 
 		 219 aa  241  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  53.99 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  59.35 
 
 		 194 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  53.08 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  53.08 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  54.19 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  54.67 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  52.63 
 
 		 214 aa  224  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  49.54 
 
 		 219 aa  224  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  53.67 
 
 		 214 aa  223  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  50.93 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  50.23 
 
 		 217 aa  221  7e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  221  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  51.64 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  53.21 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  52.15 
 
 		 214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  50 
 
 		 217 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  49.07 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  48.84 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  52.29 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  51.83 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  52.75 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  52.75 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  55.14 
 
 		 195 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  53.95 
 
 		 194 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  53.02 
 
 		 194 aa  215  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  53.02 
 
 		 194 aa  215  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  50.72 
 
 		 215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  51.89 
 
 		 195 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  48.84 
 
 		 217 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  50.23 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  49.77 
 
 		 213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  50.47 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  52.75 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  48.61 
 
 		 216 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  52.78 
 
 		 192 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  48.6 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  50.24 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  50 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  48.15 
 
 		 216 aa  210  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  50.23 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  50.23 
 
 		 214 aa  208  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  45.83 
 
 		 218 aa  208  5e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  48.82 
 
 		 211 aa  208  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  50 
 
 		 214 aa  207  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  50 
 
 		 214 aa  207  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  52.51 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  50 
 
 		 214 aa  207  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  47.42 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  46.3 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  50.7 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  47.22 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  46.34 
 
 		 423 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  48.79 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  53.52 
 
 		 200 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  51.85 
 
 		 199 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  50.23 
 
 		 214 aa  205  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  49.77 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  50.92 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  50.92 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  50.92 
 
 		 214 aa  205  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  49.55 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  49.55 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  50.46 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  51.6 
 
 		 214 aa  204  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  50 
 
 		 214 aa  204  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>