More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1212 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  97.94 
 
 
194 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  80.1 
 
 
192 aa  312  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  66.49 
 
 
194 aa  251  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  63.87 
 
 
193 aa  244  8e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  60.21 
 
 
193 aa  244  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  62.83 
 
 
199 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  61.66 
 
 
200 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  58.64 
 
 
192 aa  239  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  61.86 
 
 
195 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  59.69 
 
 
199 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  61.26 
 
 
309 aa  232  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  60.21 
 
 
208 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  59.16 
 
 
200 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  59.16 
 
 
200 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  62.3 
 
 
205 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  56.28 
 
 
216 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  60.73 
 
 
367 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  58.64 
 
 
205 aa  225  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  57.59 
 
 
200 aa  224  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  58.12 
 
 
206 aa  224  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  54.88 
 
 
216 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  58.42 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  58.12 
 
 
341 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  58.12 
 
 
360 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  60.73 
 
 
335 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  53.02 
 
 
216 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  55.08 
 
 
192 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  52.88 
 
 
189 aa  193  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  48.57 
 
 
224 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  51.85 
 
 
193 aa  191  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  49.3 
 
 
216 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  47.47 
 
 
214 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  44.34 
 
 
220 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  47.49 
 
 
214 aa  185  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  47.95 
 
 
214 aa  184  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  50.54 
 
 
189 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  47.03 
 
 
234 aa  184  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  46.48 
 
 
219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  46.08 
 
 
214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  50.48 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  46.58 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  51.34 
 
 
187 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  46.08 
 
 
214 aa  181  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  46.54 
 
 
214 aa  181  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  49.04 
 
 
214 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  46.7 
 
 
222 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  48.69 
 
 
191 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  48.56 
 
 
214 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  49.3 
 
 
219 aa  178  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  47.44 
 
 
215 aa  177  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  44.81 
 
 
217 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0815  adenylate kinase  47.49 
 
 
215 aa  177  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  46.45 
 
 
227 aa  177  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  45.66 
 
 
214 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  45.66 
 
 
214 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  45.66 
 
 
214 aa  177  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  43.87 
 
 
213 aa  177  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  45.58 
 
 
217 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  46.48 
 
 
214 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  46.48 
 
 
215 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  47.31 
 
 
191 aa  174  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  44.7 
 
 
214 aa  174  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  46.12 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  49.73 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  44.86 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  45.12 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  44.34 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  45.12 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.54 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  45.79 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  45.79 
 
 
218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  43.58 
 
 
215 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  46.88 
 
 
193 aa  171  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  47.39 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  44.7 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  45.41 
 
 
213 aa  171  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  45.95 
 
 
181 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  45.95 
 
 
181 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  45.95 
 
 
181 aa  171  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  45.19 
 
 
214 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  44.44 
 
 
217 aa  170  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  45.79 
 
 
218 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  45.02 
 
 
213 aa  169  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  44.39 
 
 
218 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>