More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2797 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  100 
 
 
219 aa  437  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  77.46 
 
 
215 aa  337  9e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  72.77 
 
 
216 aa  318  5e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  55.09 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  55.4 
 
 
216 aa  241  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  55.61 
 
 
217 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  55.61 
 
 
229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  55.3 
 
 
224 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  55.35 
 
 
216 aa  236  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  54.46 
 
 
229 aa  235  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  54.42 
 
 
219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  53.02 
 
 
216 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  53.95 
 
 
218 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  53.92 
 
 
217 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  53.92 
 
 
217 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  54.46 
 
 
217 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  50.47 
 
 
213 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  50.7 
 
 
227 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  52.8 
 
 
213 aa  209  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  48.8 
 
 
214 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  49.03 
 
 
214 aa  205  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  48.83 
 
 
214 aa  204  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  50.47 
 
 
216 aa  201  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  51.61 
 
 
195 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  46.48 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  44.39 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  47.69 
 
 
213 aa  194  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  44.13 
 
 
220 aa  193  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  47.22 
 
 
217 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  46.83 
 
 
214 aa  191  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  46.05 
 
 
222 aa  191  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  45.45 
 
 
423 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.86 
 
 
219 aa  191  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  46.95 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  45.5 
 
 
217 aa  188  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  50.7 
 
 
193 aa  189  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  44.5 
 
 
217 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  42.58 
 
 
216 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.79 
 
 
217 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  42.99 
 
 
217 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  44.39 
 
 
215 aa  184  9e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  51.38 
 
 
194 aa  181  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  46.73 
 
 
199 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  45.54 
 
 
189 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  48.58 
 
 
195 aa  179  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  46.98 
 
 
199 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  42.52 
 
 
216 aa  178  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.02 
 
 
226 aa  178  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  44.19 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  42.79 
 
 
215 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  49.3 
 
 
194 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  48.83 
 
 
193 aa  178  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  49.3 
 
 
194 aa  178  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  47.2 
 
 
193 aa  178  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  42.06 
 
 
216 aa  177  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  43.48 
 
 
217 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  47.49 
 
 
214 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.44 
 
 
213 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  44.6 
 
 
218 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.79 
 
 
211 aa  176  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  47.03 
 
 
214 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.02 
 
 
226 aa  175  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  43.19 
 
 
215 aa  175  6e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  44.93 
 
 
217 aa  175  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  48.37 
 
 
194 aa  175  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.76 
 
 
220 aa  174  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  42.72 
 
 
215 aa  174  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  42.72 
 
 
215 aa  174  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  44.75 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  43.75 
 
 
218 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  43.33 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  42.51 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  41.86 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  44.23 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  44.23 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  40.65 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4935  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.26 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000314171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  37.67 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  37.67 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  45.66 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  45.45 
 
 
227 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  46.05 
 
 
200 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  45.7 
 
 
234 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  42.72 
 
 
219 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  170  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  170  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  170  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  46.12 
 
 
214 aa  170  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  49.47 
 
 
215 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  44.13 
 
 
200 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>