More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2667 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  100 
 
 		 195 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  58.42 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  58.42 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  58.42 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  59.26 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  57.07 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  58.95 
 
 		 194 aa  218  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  58.03 
 
 		 195 aa  217  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  56.32 
 
 		 200 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  56.54 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  51.89 
 
 		 216 aa  214  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  57.37 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  54.45 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  56.84 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  55.79 
 
 		 206 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  56.02 
 
 		 360 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  56.32 
 
 		 309 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  54.21 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  51.42 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  50.71 
 
 		 224 aa  208  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  55.26 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  56.45 
 
 		 367 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  55.26 
 
 		 200 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  56.32 
 
 		 341 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  54.21 
 
 		 200 aa  205  4e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  49.3 
 
 		 216 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  47.17 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  51.31 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  47 
 
 		 214 aa  191  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  46.19 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  45.02 
 
 		 227 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  47.47 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  47.47 
 
 		 214 aa  186  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  47 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  53.4 
 
 		 335 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  48.95 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  45.89 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  51.67 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  45.62 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  184  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  46.08 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  50.56 
 
 		 187 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  46.08 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  48.13 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  46.92 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  47.2 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  44.24 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  48.58 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  47.87 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05122  Adenylate kinase 1 (AK 1)(EC 2.7.4.3)(ATP-AMP transphosphorylase 1)(Adenylate kinase cytosolic and mitochondrial) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V8]  43.93 
 
 		 259 aa  178  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  45.83 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  50 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  43.78 
 
 		 214 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  44.44 
 
 		 214 aa  176  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  45.62 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  45.62 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  45.62 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  45.62 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  45.62 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  43.52 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  45.16 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03420  adenylate kinase, putative  43.87 
 
 		 269 aa  175  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  43.35 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  45.5 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  48.35 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  42.92 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  44.44 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  43.98 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  43.98 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  43.98 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  43.98 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  44.24 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  43.52 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  43.52 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  43.52 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  43.52 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  43.56 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65737  Adenylate kinase (ATP-AMP transphosphorylase)  44.13 
 
 		 249 aa  172  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  43.58 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  43.78 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  43.78 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  43.78 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  44.91 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  42.92 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  44.65 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  47.57 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  47.06 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  43.32 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  46.49 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  42.45 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  42.79 
 
 		 423 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  46.03 
 
 		 187 aa  169  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  42.86 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>