More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4777 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  100 
 
 
195 aa  380  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  68.59 
 
 
200 aa  263  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  68.59 
 
 
199 aa  263  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  67.71 
 
 
193 aa  257  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  67.02 
 
 
199 aa  255  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  67.53 
 
 
208 aa  254  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  63.35 
 
 
200 aa  251  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  66.49 
 
 
193 aa  252  3e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  64.4 
 
 
200 aa  251  6e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  64.4 
 
 
200 aa  250  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  64.95 
 
 
194 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  65.97 
 
 
206 aa  241  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  64.06 
 
 
309 aa  239  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  61.86 
 
 
194 aa  238  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  61.86 
 
 
194 aa  238  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  61.34 
 
 
194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  63.1 
 
 
367 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  60.94 
 
 
192 aa  228  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  60.73 
 
 
341 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  60.21 
 
 
360 aa  223  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  54.42 
 
 
216 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  63.39 
 
 
205 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  64.06 
 
 
335 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  58.03 
 
 
195 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  53.49 
 
 
216 aa  216  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  55.14 
 
 
216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  58.29 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  57.59 
 
 
205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  52.31 
 
 
224 aa  202  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  54.17 
 
 
189 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  52.8 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  53.74 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  53.93 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  51.61 
 
 
219 aa  199  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  53.37 
 
 
188 aa  191  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  54.55 
 
 
187 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  49.74 
 
 
192 aa  188  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  50.24 
 
 
227 aa  187  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  46.48 
 
 
213 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.7 
 
 
220 aa  184  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  53.93 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  48.08 
 
 
214 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  46.89 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  48.53 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  49.52 
 
 
217 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  49.52 
 
 
229 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  46.76 
 
 
217 aa  177  9e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  47.12 
 
 
217 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  50.49 
 
 
229 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  46.38 
 
 
208 aa  176  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  49.46 
 
 
189 aa  175  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  47.47 
 
 
229 aa  174  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  49.29 
 
 
217 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  49.29 
 
 
217 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  49.29 
 
 
217 aa  174  7e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  45.9 
 
 
192 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  46.63 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  45.63 
 
 
217 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  46.26 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  49.73 
 
 
204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  46.45 
 
 
192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  45.19 
 
 
423 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  47.6 
 
 
216 aa  171  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  44.23 
 
 
217 aa  170  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  51.34 
 
 
187 aa  171  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  46.15 
 
 
214 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  43.6 
 
 
240 aa  170  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  43.81 
 
 
190 aa  170  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  50.8 
 
 
187 aa  169  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  40.85 
 
 
213 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  46.08 
 
 
217 aa  169  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  46.99 
 
 
197 aa  168  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  47.06 
 
 
191 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  43.75 
 
 
213 aa  167  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  44.34 
 
 
217 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  45.79 
 
 
193 aa  166  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  45.67 
 
 
213 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  51.1 
 
 
182 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  48.42 
 
 
192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  49.74 
 
 
208 aa  164  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  45.11 
 
 
195 aa  164  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  46.84 
 
 
195 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  46.67 
 
 
213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.13 
 
 
211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  46.57 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  42.51 
 
 
213 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.54 
 
 
217 aa  164  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  44.86 
 
 
218 aa  164  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  45.67 
 
 
213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  43.87 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  41.74 
 
 
214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1362  adenylate kinase  42.27 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  44.66 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  44.13 
 
 
217 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  42.99 
 
 
222 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  43.58 
 
 
214 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  44.88 
 
 
217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  42.08 
 
 
225 aa  161  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1366  adenylate kinase  41.82 
 
 
218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>