More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1566 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  86.6 
 
 		 206 aa  337  5.9999999999999996e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  80.63 
 
 		 360 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  79.17 
 
 		 367 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  78.12 
 
 		 341 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  73.43 
 
 		 309 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  83.25 
 
 		 335 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  65.62 
 
 		 200 aa  254  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  67.53 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  64.92 
 
 		 199 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  63.1 
 
 		 199 aa  244  9e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  62.3 
 
 		 193 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  59.9 
 
 		 200 aa  238  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  60.42 
 
 		 200 aa  236  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  59.9 
 
 		 200 aa  235  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  60.21 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  60.21 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  59.9 
 
 		 193 aa  231  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  60.21 
 
 		 194 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  63.35 
 
 		 205 aa  228  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  59.69 
 
 		 192 aa  227  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  58.38 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  54.45 
 
 		 192 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  55.21 
 
 		 192 aa  211  7.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  54.21 
 
 		 195 aa  209  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  55.15 
 
 		 194 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.23 
 
 		 216 aa  197  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  54.01 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  49.3 
 
 		 216 aa  194  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  50.7 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  46.76 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  49.3 
 
 		 216 aa  184  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  49.06 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  49.21 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  45.07 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  44.86 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  44.13 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  43.4 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  46.51 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  43.93 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  47.67 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  48.56 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  44.39 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  48.56 
 
 		 214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  44.13 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  45.79 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  48.63 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  42.47 
 
 		 423 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  41.55 
 
 		 213 aa  171  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  43.66 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  43.81 
 
 		 190 aa  171  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  44.91 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  45.07 
 
 		 229 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  41.63 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  46.67 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  45.12 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  43.98 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  45.12 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  43.27 
 
 		 213 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  44.81 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  44.81 
 
 		 229 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  44.81 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  43.56 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  47.17 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  42.93 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  46.49 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  47.67 
 
 		 186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  41.04 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  49.46 
 
 		 182 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  43.27 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1366  adenylate kinase  41.18 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  43.69 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  41.59 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  42.44 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  44.23 
 
 		 213 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  41.82 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  42.01 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  42.53 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1362  adenylate kinase  40.72 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  44.23 
 
 		 204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  48.13 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  42.08 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  43.19 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  46.45 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  46.45 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  40.27 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  41.98 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  40.27 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  46.45 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  41.36 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  48.44 
 
 		 191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  42.44 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  46.99 
 
 		 181 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  47.59 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.4 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  42.4 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  47.37 
 
 		 184 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  42.4 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  42.4 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  42.4 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>