More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2533 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  100 
 
 		 222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  91.86 
 
 		 222 aa  418  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  91.86 
 
 		 222 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  86.43 
 
 		 221 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  85.52 
 
 		 221 aa  390  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  80.54 
 
 		 221 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0309  adenylate kinase  80.09 
 
 		 221 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  76.47 
 
 		 221 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  77.03 
 
 		 218 aa  354  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  76.47 
 
 		 221 aa  354  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  75.57 
 
 		 221 aa  352  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  77.83 
 
 		 217 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  77.73 
 
 		 218 aa  347  1e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  74.77 
 
 		 218 aa  345  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  74.77 
 
 		 218 aa  345  4e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  78.64 
 
 		 218 aa  344  5e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  76.23 
 
 		 220 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  75.91 
 
 		 218 aa  340  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  77.27 
 
 		 218 aa  338  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  75.34 
 
 		 220 aa  338  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  74.89 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  74.89 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  74.89 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  74.89 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  75.34 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  74.89 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  75.34 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  74.89 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  74.89 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  75.34 
 
 		 220 aa  337  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  72.85 
 
 		 217 aa  336  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  77.73 
 
 		 217 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  74.89 
 
 		 220 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  74.44 
 
 		 220 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  74.44 
 
 		 220 aa  334  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  72.97 
 
 		 218 aa  332  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  75.91 
 
 		 217 aa  331  6e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  73.64 
 
 		 218 aa  331  7.000000000000001e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  73.18 
 
 		 217 aa  325  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  69.68 
 
 		 218 aa  318  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  71.36 
 
 		 216 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  71.36 
 
 		 216 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  69.09 
 
 		 222 aa  314  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  70.45 
 
 		 216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  70.45 
 
 		 216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1416  adenylate kinase  67.57 
 
 		 219 aa  310  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  66.52 
 
 		 215 aa  308  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  67.12 
 
 		 218 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  66.36 
 
 		 215 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  66.97 
 
 		 219 aa  304  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  66.82 
 
 		 215 aa  304  7e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  66.36 
 
 		 215 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  66.52 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  66.36 
 
 		 216 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  70.91 
 
 		 218 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  65.61 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  63.8 
 
 		 217 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  67.87 
 
 		 215 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  67.13 
 
 		 214 aa  299  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1541  adenylate kinase  63.96 
 
 		 218 aa  299  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0259287  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1510  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  65.91 
 
 		 218 aa  297  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  64.41 
 
 		 219 aa  296  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1168  adenylate kinase  63.96 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.949155  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  67.42 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  65 
 
 		 214 aa  290  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1366  adenylate kinase  63.51 
 
 		 218 aa  288  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  63.64 
 
 		 214 aa  288  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1362  adenylate kinase  63.06 
 
 		 218 aa  287  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  61.82 
 
 		 214 aa  287  9e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  63.35 
 
 		 218 aa  286  1e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0741  adenylate kinase  64.19 
 
 		 212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0160086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  63.18 
 
 		 214 aa  285  4e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  63.35 
 
 		 214 aa  284  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  63.35 
 
 		 214 aa  284  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  63.35 
 
 		 214 aa  284  9e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  63.35 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  63.35 
 
 		 214 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  62.44 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  63.35 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  61.36 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  62.9 
 
 		 214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  62.9 
 
 		 214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  62.9 
 
 		 214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0827  adenylate kinase  60.36 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.117241  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  62.9 
 
 		 214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  62.27 
 
 		 214 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  61.36 
 
 		 214 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  62.84 
 
 		 214 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  61.57 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  63.21 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  63.21 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  61.57 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  63.21 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  61.57 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  63.21 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  63.21 
 
 		 214 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  60.91 
 
 		 214 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  61.36 
 
 		 214 aa  279  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0949  adenylate kinase  60.91 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.675303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  63.21 
 
 		 214 aa  278  6e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>