More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3427 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  100 
 
 		 335 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  73.48 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  76.15 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  80.93 
 
 		 341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  80 
 
 		 367 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  80.6 
 
 		 208 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  78.53 
 
 		 206 aa  311  9e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  61.31 
 
 		 199 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  61.81 
 
 		 199 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  63.87 
 
 		 200 aa  248  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  63.73 
 
 		 193 aa  247  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  64.06 
 
 		 195 aa  242  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  62.18 
 
 		 193 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  60.73 
 
 		 194 aa  236  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  60.73 
 
 		 194 aa  236  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  60.73 
 
 		 194 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  60.42 
 
 		 192 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  59.18 
 
 		 200 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  58.97 
 
 		 200 aa  229  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  58.97 
 
 		 200 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  61.46 
 
 		 205 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  57.92 
 
 		 205 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  57.29 
 
 		 194 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  54.97 
 
 		 192 aa  210  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.47 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  53.4 
 
 		 195 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  50 
 
 		 216 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  48.36 
 
 		 224 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  49.07 
 
 		 216 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  52.06 
 
 		 189 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  50 
 
 		 192 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  51.15 
 
 		 214 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  50.23 
 
 		 214 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  47.44 
 
 		 216 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  44.24 
 
 		 220 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  47.6 
 
 		 217 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  45.97 
 
 		 215 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  45.67 
 
 		 214 aa  182  7e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  45.62 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  48.98 
 
 		 186 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  45.07 
 
 		 213 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  45.54 
 
 		 229 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  45.54 
 
 		 217 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  45.37 
 
 		 213 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  45.87 
 
 		 214 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  49.21 
 
 		 193 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  42.99 
 
 		 213 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  46.26 
 
 		 227 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  45.99 
 
 		 190 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  46.15 
 
 		 214 aa  175  9e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  42.13 
 
 		 217 aa  175  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  43.81 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  45.33 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  45.28 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  49.04 
 
 		 216 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.01 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7769  adenylate kinase  51.43 
 
 		 185 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  47.85 
 
 		 217 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  43.93 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  43.93 
 
 		 218 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  40.65 
 
 		 216 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  40.65 
 
 		 216 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  47.54 
 
 		 181 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  43.98 
 
 		 219 aa  172  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  47.54 
 
 		 181 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  47.54 
 
 		 181 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  46.01 
 
 		 217 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  43.95 
 
 		 218 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  43.84 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  46.63 
 
 		 217 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  44.24 
 
 		 217 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  49.48 
 
 		 184 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  43.5 
 
 		 217 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  47.54 
 
 		 181 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  43.11 
 
 		 219 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  48.7 
 
 		 193 aa  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  48.13 
 
 		 222 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  40.61 
 
 		 222 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  48.68 
 
 		 218 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  45.92 
 
 		 183 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  45.5 
 
 		 215 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  42.67 
 
 		 218 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  42.67 
 
 		 218 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  45.5 
 
 		 217 aa  169  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  47.31 
 
 		 218 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  41.89 
 
 		 218 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  40.85 
 
 		 217 aa  169  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  46.43 
 
 		 187 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  45.54 
 
 		 217 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  40.17 
 
 		 222 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  45.54 
 
 		 217 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  43.66 
 
 		 214 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  46.91 
 
 		 195 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  46.77 
 
 		 217 aa  168  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  43.11 
 
 		 218 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  42.58 
 
 		 213 aa  168  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  39.82 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  48.63 
 
 		 181 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  42.2 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1366  adenylate kinase  42.27 
 
 		 218 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>