More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20660 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  100 
 
 
193 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  69.19 
 
 
192 aa  264  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  64.09 
 
 
211 aa  230  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  62.03 
 
 
191 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  61.41 
 
 
201 aa  228  4e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  59.26 
 
 
192 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  58.06 
 
 
205 aa  224  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  59.68 
 
 
191 aa  224  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  58.15 
 
 
189 aa  221  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  58.33 
 
 
194 aa  219  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  56.25 
 
 
195 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  54.84 
 
 
192 aa  214  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  56.76 
 
 
186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  55.38 
 
 
192 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  56.19 
 
 
204 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  53.93 
 
 
197 aa  207  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  51.79 
 
 
197 aa  205  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  50.23 
 
 
216 aa  198  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  54.3 
 
 
184 aa  194  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  51.89 
 
 
186 aa  194  9e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  49.07 
 
 
219 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  52.22 
 
 
187 aa  191  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  51.18 
 
 
217 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  50.71 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  52.11 
 
 
199 aa  187  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  54.35 
 
 
181 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  54.35 
 
 
181 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  48.82 
 
 
217 aa  186  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  54.35 
 
 
181 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  50.54 
 
 
187 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  50.54 
 
 
187 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  50.26 
 
 
200 aa  185  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  49.29 
 
 
217 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  51.31 
 
 
199 aa  184  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  48.17 
 
 
195 aa  184  9e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  49.74 
 
 
200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  49.21 
 
 
200 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  53.26 
 
 
181 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  46.45 
 
 
217 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  50 
 
 
194 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  50 
 
 
182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  50.26 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  47.78 
 
 
211 aa  177  9e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  48.96 
 
 
200 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  46.67 
 
 
218 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  49.16 
 
 
183 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  47.64 
 
 
192 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  50.81 
 
 
181 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  45.97 
 
 
217 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  50 
 
 
192 aa  175  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  44.64 
 
 
225 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  51.63 
 
 
187 aa  174  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  42.99 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  42.63 
 
 
374 aa  171  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  46.88 
 
 
194 aa  171  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  46.88 
 
 
194 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  46.38 
 
 
214 aa  171  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  46.43 
 
 
205 aa  171  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  46.88 
 
 
194 aa  171  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  46.38 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  43.93 
 
 
220 aa  170  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  48.37 
 
 
184 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  43.93 
 
 
220 aa  170  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  50 
 
 
181 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  42.59 
 
 
217 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  45.02 
 
 
217 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  46.84 
 
 
193 aa  167  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  42.65 
 
 
215 aa  167  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  43.52 
 
 
217 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  45.41 
 
 
186 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  43.6 
 
 
214 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  48.13 
 
 
205 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  47.85 
 
 
184 aa  166  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  44.74 
 
 
190 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  45.79 
 
 
195 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  41.58 
 
 
367 aa  166  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  41.23 
 
 
213 aa  166  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  42.92 
 
 
216 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.71 
 
 
216 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.71 
 
 
216 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  43.81 
 
 
214 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  41.86 
 
 
216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  45.7 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  44.21 
 
 
193 aa  164  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  42.06 
 
 
215 aa  164  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  42.45 
 
 
219 aa  164  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  47.89 
 
 
206 aa  164  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  44.13 
 
 
215 aa  164  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  42.59 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  43.81 
 
 
214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  40.47 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  44.19 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  48.11 
 
 
188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  40.19 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  40.76 
 
 
215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  45.26 
 
 
309 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  43.33 
 
 
216 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  43.66 
 
 
214 aa  161  6e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  42.66 
 
 
215 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  46.84 
 
 
360 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>