More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2180 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  99.5 
 
 
200 aa  390  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  100 
 
 
200 aa  391  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  93 
 
 
200 aa  367  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  77.89 
 
 
199 aa  304  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  76.88 
 
 
199 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  76 
 
 
200 aa  296  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  68.06 
 
 
193 aa  263  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  64.4 
 
 
195 aa  250  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  62.83 
 
 
309 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  61.26 
 
 
193 aa  245  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  62.83 
 
 
194 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  62.83 
 
 
206 aa  237  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  59.9 
 
 
208 aa  235  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  61.46 
 
 
205 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  59.16 
 
 
194 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  59.16 
 
 
194 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  59.16 
 
 
194 aa  228  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  59.16 
 
 
192 aa  225  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  60.21 
 
 
360 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  59.18 
 
 
341 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  59.49 
 
 
367 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  58.97 
 
 
335 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  54.69 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  55.26 
 
 
195 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  59.16 
 
 
205 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  53.48 
 
 
192 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.7 
 
 
216 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  49.06 
 
 
213 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  47.42 
 
 
216 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  52.36 
 
 
189 aa  188  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  45.79 
 
 
220 aa  184  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  47.89 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  45.33 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  49.74 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  47.2 
 
 
219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  43.96 
 
 
213 aa  181  5.0000000000000004e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  47.67 
 
 
187 aa  181  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  47.89 
 
 
216 aa  180  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  47.8 
 
 
229 aa  180  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  52.43 
 
 
204 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  48.42 
 
 
193 aa  180  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  45.75 
 
 
227 aa  178  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  44.81 
 
 
213 aa  178  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  46.45 
 
 
240 aa  177  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  44.29 
 
 
214 aa  174  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05122  Adenylate kinase 1 (AK 1)(EC 2.7.4.3)(ATP-AMP transphosphorylase 1)(Adenylate kinase cytosolic and mitochondrial) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V8]  48.22 
 
 
259 aa  174  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  47.64 
 
 
216 aa  174  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  43.87 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  48.96 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  42.79 
 
 
215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  48.37 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.83 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  43.3 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03420  adenylate kinase, putative  41.47 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.621888  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  47.83 
 
 
187 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  47.09 
 
 
208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  49.01 
 
 
217 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  46.27 
 
 
214 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  49.01 
 
 
229 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  43.69 
 
 
208 aa  171  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  44.13 
 
 
219 aa  171  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  43.26 
 
 
215 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  43.26 
 
 
215 aa  171  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  44.09 
 
 
217 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  44.29 
 
 
214 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  43.26 
 
 
217 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  46.3 
 
 
215 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  42.22 
 
 
222 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  46.01 
 
 
229 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  44.23 
 
 
217 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.14 
 
 
211 aa  169  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  45.9 
 
 
201 aa  168  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.78 
 
 
219 aa  168  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  49.48 
 
 
191 aa  168  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  42.72 
 
 
217 aa  168  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  46.99 
 
 
181 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  46.99 
 
 
181 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  46.99 
 
 
181 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  42.79 
 
 
213 aa  167  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  46.99 
 
 
181 aa  167  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  42.06 
 
 
215 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  45.9 
 
 
187 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  46.91 
 
 
192 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  44.7 
 
 
214 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.62 
 
 
216 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.62 
 
 
216 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  44.67 
 
 
191 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  46.41 
 
 
423 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12732  predicted protein  41.7 
 
 
228 aa  166  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  47.31 
 
 
217 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  43.32 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  45.9 
 
 
192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  43.18 
 
 
219 aa  165  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  43.32 
 
 
227 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  41.2 
 
 
216 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  45.99 
 
 
215 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  46 
 
 
216 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37399  predicted protein  45.05 
 
 
239 aa  165  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.889133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  43.78 
 
 
214 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>