More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6306 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  56.54 
 
 
200 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  56.02 
 
 
193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  58.29 
 
 
195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  56.02 
 
 
206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  54.69 
 
 
193 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  54.45 
 
 
208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  56.54 
 
 
199 aa  208  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  54.01 
 
 
200 aa  208  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  55.98 
 
 
199 aa  207  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  53.48 
 
 
200 aa  205  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  53.48 
 
 
200 aa  205  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  53.09 
 
 
341 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  52.94 
 
 
360 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  51.04 
 
 
309 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  52.88 
 
 
367 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  54.69 
 
 
192 aa  201  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  54.97 
 
 
205 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  55.08 
 
 
194 aa  194  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  55.08 
 
 
194 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  55.08 
 
 
194 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  50 
 
 
335 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  50.8 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  47.2 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  48.69 
 
 
205 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  50.54 
 
 
192 aa  180  9.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  44.71 
 
 
213 aa  176  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  46.26 
 
 
216 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  43.87 
 
 
213 aa  174  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  45.79 
 
 
216 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  48.44 
 
 
189 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  45.54 
 
 
224 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  44.13 
 
 
217 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  48.65 
 
 
193 aa  168  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  47.85 
 
 
195 aa  168  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  43.4 
 
 
216 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  44.81 
 
 
216 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  44.5 
 
 
187 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  46.07 
 
 
187 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  45.07 
 
 
214 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  46.88 
 
 
204 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  45.55 
 
 
187 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  47.85 
 
 
182 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  42.18 
 
 
214 aa  164  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  45.16 
 
 
195 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  40.85 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  44.83 
 
 
229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  42.25 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  42.73 
 
 
218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  47.4 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  43.66 
 
 
217 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  43.66 
 
 
217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  42.47 
 
 
215 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  42.25 
 
 
219 aa  160  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  46.6 
 
 
208 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  45.41 
 
 
208 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  41.51 
 
 
213 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  45.03 
 
 
192 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  39.61 
 
 
215 aa  158  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  44.81 
 
 
197 aa  158  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  42.92 
 
 
214 aa  157  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  41.1 
 
 
215 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  40 
 
 
216 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  42.93 
 
 
217 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  41.1 
 
 
215 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  42.93 
 
 
229 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  37.26 
 
 
216 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  37.26 
 
 
216 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  44.5 
 
 
192 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  43.68 
 
 
193 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  45.93 
 
 
215 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  44.39 
 
 
217 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  41.35 
 
 
216 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  41.88 
 
 
192 aa  155  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  42.31 
 
 
216 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  40 
 
 
222 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  42.92 
 
 
217 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  43.48 
 
 
208 aa  155  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  42.45 
 
 
217 aa  154  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  41.78 
 
 
423 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  44.5 
 
 
216 aa  154  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  42.31 
 
 
216 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  42.31 
 
 
216 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  42.31 
 
 
216 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  42.31 
 
 
216 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  42.31 
 
 
216 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  41.83 
 
 
216 aa  153  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  41.58 
 
 
229 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  41.83 
 
 
216 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  42.31 
 
 
222 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  39.91 
 
 
217 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  40.64 
 
 
215 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  41.83 
 
 
216 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  43.23 
 
 
201 aa  153  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  44.79 
 
 
188 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  41.36 
 
 
225 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  42.25 
 
 
213 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  40.57 
 
 
214 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  42.41 
 
 
191 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  42.2 
 
 
214 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>