More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1270 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  100 
 
 
216 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  80.28 
 
 
215 aa  352  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  72.77 
 
 
219 aa  318  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  55.81 
 
 
219 aa  258  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  59.62 
 
 
224 aa  254  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  55.61 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  56.87 
 
 
217 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  56.87 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  56.54 
 
 
216 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  54.5 
 
 
229 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  54.67 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  53.02 
 
 
229 aa  234  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  52.11 
 
 
213 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  51.18 
 
 
227 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  52.31 
 
 
217 aa  224  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  52.31 
 
 
217 aa  224  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  52.31 
 
 
217 aa  224  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  49.3 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  53.05 
 
 
213 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  49.3 
 
 
214 aa  215  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.44 
 
 
214 aa  214  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  47.44 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  49.53 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  51.17 
 
 
216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  45.37 
 
 
222 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  47.2 
 
 
213 aa  208  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  46.48 
 
 
217 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  46.05 
 
 
216 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  48.57 
 
 
423 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  45.58 
 
 
217 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  45.83 
 
 
218 aa  202  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  42.99 
 
 
219 aa  201  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  45.54 
 
 
215 aa  201  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  47.42 
 
 
214 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  53.74 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  46.48 
 
 
217 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  47.2 
 
 
217 aa  198  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  53.27 
 
 
192 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  49.53 
 
 
189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.54 
 
 
217 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  45.12 
 
 
213 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  44.19 
 
 
215 aa  193  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  44.39 
 
 
216 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  42.72 
 
 
216 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  44.98 
 
 
217 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  43.46 
 
 
215 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0311  adenylate kinase  42.99 
 
 
217 aa  191  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000173731  unclonable  2.3199200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.23 
 
 
220 aa  191  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  44.13 
 
 
217 aa  191  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  44.23 
 
 
218 aa  191  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  49.3 
 
 
194 aa  189  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  43.66 
 
 
215 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  43.66 
 
 
215 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  49.3 
 
 
194 aa  189  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  45.15 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  44.6 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  45.07 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  44.13 
 
 
217 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  43.66 
 
 
215 aa  188  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  44.02 
 
 
215 aa  188  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  44.39 
 
 
214 aa  188  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  49.3 
 
 
194 aa  188  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  50.93 
 
 
194 aa  188  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  40.93 
 
 
216 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  40.93 
 
 
216 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  44.39 
 
 
217 aa  187  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  50.7 
 
 
193 aa  187  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  44.02 
 
 
218 aa  187  9e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  49.3 
 
 
206 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  51.85 
 
 
222 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  48.36 
 
 
199 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  49.76 
 
 
367 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  43.66 
 
 
217 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  43.6 
 
 
213 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  50.26 
 
 
218 aa  184  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  50.26 
 
 
218 aa  184  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  48.37 
 
 
309 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.39 
 
 
218 aa  184  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  49.3 
 
 
208 aa  184  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  48.83 
 
 
199 aa  184  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  43.93 
 
 
213 aa  184  9e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  45.87 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  45.87 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  45.58 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  48.6 
 
 
193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  45.87 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>