More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1353 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  100 
 
 
216 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  89.81 
 
 
216 aa  403  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  79.63 
 
 
216 aa  357  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  58.6 
 
 
217 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  58.6 
 
 
217 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  58.14 
 
 
217 aa  260  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  57.28 
 
 
213 aa  254  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  55.09 
 
 
218 aa  251  8.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  54.88 
 
 
224 aa  250  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  56.54 
 
 
216 aa  250  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  62.79 
 
 
194 aa  250  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  57.28 
 
 
213 aa  248  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  56.34 
 
 
229 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  55.61 
 
 
227 aa  247  8e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  53.7 
 
 
219 aa  245  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  55.61 
 
 
217 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  55.61 
 
 
229 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  55.14 
 
 
229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  54.46 
 
 
215 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  55.35 
 
 
219 aa  236  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  56.74 
 
 
194 aa  228  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  56.28 
 
 
194 aa  228  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  56.28 
 
 
194 aa  228  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  50.23 
 
 
217 aa  224  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  55.56 
 
 
192 aa  223  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  54.46 
 
 
216 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  54.42 
 
 
195 aa  223  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  50.23 
 
 
214 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  49.54 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  51.67 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  51.17 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  48.61 
 
 
423 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  52.38 
 
 
214 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  49.54 
 
 
217 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  52.38 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  52.29 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  47.69 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  48.37 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  52.51 
 
 
214 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  48.61 
 
 
215 aa  214  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  51.64 
 
 
214 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  51.69 
 
 
217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  214  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  52.75 
 
 
234 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  50.97 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  53.21 
 
 
214 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  49.3 
 
 
205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  46.73 
 
 
217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  50.92 
 
 
214 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  53.05 
 
 
200 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  48.36 
 
 
213 aa  211  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  53 
 
 
199 aa  211  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  50.49 
 
 
217 aa  211  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  211  9e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  211  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  211  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  48.6 
 
 
217 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  47.42 
 
 
217 aa  210  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  52.29 
 
 
214 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  47.22 
 
 
219 aa  209  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  209  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0815  adenylate kinase  51.36 
 
 
215 aa  209  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  51.42 
 
 
195 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  51.6 
 
 
214 aa  208  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  50.23 
 
 
222 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  208  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  46.95 
 
 
217 aa  208  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  50.68 
 
 
214 aa  207  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.6 
 
 
220 aa  207  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  47.6 
 
 
218 aa  207  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.51 
 
 
217 aa  207  9e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  52.31 
 
 
199 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  46.3 
 
 
215 aa  207  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  49.28 
 
 
215 aa  207  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  49.55 
 
 
215 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  51.16 
 
 
193 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  45.83 
 
 
217 aa  206  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  205  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  51.39 
 
 
341 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  205  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>