More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5049 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  100 
 
 		 309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  69.87 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  78.06 
 
 		 341 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  82.47 
 
 		 335 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  77.84 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  77.49 
 
 		 208 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  75.39 
 
 		 206 aa  297  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  64.92 
 
 		 200 aa  255  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  64.95 
 
 		 199 aa  254  9e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  66.3 
 
 		 199 aa  251  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  62.83 
 
 		 200 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  62.83 
 
 		 200 aa  248  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  65.28 
 
 		 193 aa  248  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  65.1 
 
 		 193 aa  248  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  60.5 
 
 		 200 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  64.06 
 
 		 195 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  61.26 
 
 		 194 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  61.26 
 
 		 194 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  61.26 
 
 		 194 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  63.02 
 
 		 205 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  60.42 
 
 		 192 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  56.1 
 
 		 205 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  57.81 
 
 		 194 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  56.02 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  53.93 
 
 		 192 aa  206  5e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  51.04 
 
 		 192 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.93 
 
 		 216 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  50 
 
 		 216 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  48.8 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  51.55 
 
 		 189 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  47.69 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.7 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  48.37 
 
 		 217 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  48.37 
 
 		 229 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  49.04 
 
 		 217 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  48.37 
 
 		 216 aa  186  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  46.15 
 
 		 214 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  48.97 
 
 		 187 aa  182  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.91 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  45.28 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  45.02 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  45.16 
 
 		 214 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  47.17 
 
 		 229 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  43.46 
 
 		 213 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  45.67 
 
 		 214 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  44.95 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  47.44 
 
 		 214 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  45.7 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  48.95 
 
 		 193 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.72 
 
 		 216 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.72 
 
 		 216 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  45.79 
 
 		 227 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7769  adenylate kinase  51.43 
 
 		 185 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  43.27 
 
 		 213 aa  176  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  43.96 
 
 		 208 aa  175  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  48.42 
 
 		 195 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  46.01 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  49.18 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  43.78 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  45.41 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  46.94 
 
 		 181 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.07 
 
 		 217 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.72 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  47.71 
 
 		 216 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  43.98 
 
 		 213 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  45.33 
 
 		 215 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  44.39 
 
 		 214 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  46.52 
 
 		 222 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  46.52 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.04 
 
 		 423 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  43.11 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  47.87 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  45.54 
 
 		 217 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  45.09 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  41.4 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  46.43 
 
 		 181 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.19 
 
 		 213 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  45.16 
 
 		 214 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  45.92 
 
 		 181 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  45.92 
 
 		 181 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  45.92 
 
 		 181 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  44.95 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  47.59 
 
 		 222 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  45.99 
 
 		 222 aa  168  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  46.77 
 
 		 217 aa  168  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  46.52 
 
 		 217 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  45.11 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  43.89 
 
 		 234 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  49.2 
 
 		 188 aa  168  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  45.99 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  44.13 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  44.13 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  46.15 
 
 		 184 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  46.56 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  43.06 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.06 
 
 		 187 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  48.7 
 
 		 191 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  47.59 
 
 		 218 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  47.59 
 
 		 218 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  44.04 
 
 		 214 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>