More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3163 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  100 
 
 		 360 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  93.88 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  69.42 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  75.23 
 
 		 309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  80.63 
 
 		 208 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  79.06 
 
 		 206 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  81.96 
 
 		 335 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  64.95 
 
 		 199 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  66.15 
 
 		 205 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  62.37 
 
 		 199 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  63.35 
 
 		 200 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  63.35 
 
 		 193 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  62.3 
 
 		 193 aa  235  9e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  61.26 
 
 		 200 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  60.21 
 
 		 200 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  60.21 
 
 		 192 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  60.21 
 
 		 200 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  60.21 
 
 		 195 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  58.12 
 
 		 194 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  58.12 
 
 		 194 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  58.55 
 
 		 205 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  58.12 
 
 		 194 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  56.02 
 
 		 195 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  51.39 
 
 		 216 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.93 
 
 		 216 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  52.94 
 
 		 192 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  54.97 
 
 		 192 aa  201  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  50 
 
 		 216 aa  199  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  54.97 
 
 		 194 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  48.8 
 
 		 224 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  52.94 
 
 		 189 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  51.05 
 
 		 193 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  46.45 
 
 		 215 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  46.01 
 
 		 213 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  48.11 
 
 		 217 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  45.67 
 
 		 214 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  48.11 
 
 		 229 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  48.34 
 
 		 227 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  45.24 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  48.34 
 
 		 229 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  45.37 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  44.49 
 
 		 222 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  46.98 
 
 		 216 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  42.73 
 
 		 222 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  47.89 
 
 		 217 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  44.05 
 
 		 222 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  46.15 
 
 		 214 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  45.54 
 
 		 213 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  47.59 
 
 		 217 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  43.4 
 
 		 220 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  47.09 
 
 		 190 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  47.42 
 
 		 217 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  42.59 
 
 		 217 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  45.45 
 
 		 217 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  47.6 
 
 		 214 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  40.65 
 
 		 216 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  40.65 
 
 		 216 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  45.98 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  43.24 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  44.81 
 
 		 217 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  46.95 
 
 		 217 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  46.95 
 
 		 217 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  46.98 
 
 		 216 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  50.27 
 
 		 188 aa  176  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.12 
 
 		 214 aa  176  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  44.65 
 
 		 229 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1362  adenylate kinase  43.64 
 
 		 218 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  48.92 
 
 		 217 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  43.06 
 
 		 216 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  49.47 
 
 		 218 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  48.47 
 
 		 187 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.71 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  45.88 
 
 		 240 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  45.07 
 
 		 218 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1366  adenylate kinase  43.18 
 
 		 218 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  44.24 
 
 		 214 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  48.13 
 
 		 222 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  48.39 
 
 		 215 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.01 
 
 		 217 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  50 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65737  Adenylate kinase (ATP-AMP transphosphorylase)  45.45 
 
 		 249 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  46.73 
 
 		 213 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  45.54 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  43.27 
 
 		 217 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  47.34 
 
 		 221 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  43.58 
 
 		 214 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  45.19 
 
 		 213 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  49.22 
 
 		 191 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  44.84 
 
 		 218 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  42.08 
 
 		 215 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  43.58 
 
 		 214 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  43.05 
 
 		 218 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  48.13 
 
 		 221 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  44.6 
 
 		 215 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  45.93 
 
 		 213 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  41.63 
 
 		 215 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  44.44 
 
 		 219 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  44.6 
 
 		 218 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  42.65 
 
 		 215 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  44.19 
 
 		 218 aa  169  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>