More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0272 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  78.38 
 
 		 186 aa  300  6.000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  61.96 
 
 		 211 aa  230  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  56.22 
 
 		 191 aa  215  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  56.52 
 
 		 192 aa  214  5.9999999999999996e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  56.76 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  52.97 
 
 		 192 aa  205  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  53.19 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  53.26 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  48.92 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  49.46 
 
 		 191 aa  191  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  53.76 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  47.31 
 
 		 187 aa  187  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  49.73 
 
 		 194 aa  185  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  50 
 
 		 205 aa  184  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  52.07 
 
 		 195 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  47.37 
 
 		 204 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  50.81 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  50.81 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  50.81 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  49.19 
 
 		 184 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  49.19 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  48.39 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  42.92 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  50.27 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  47.28 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  48.37 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  47.28 
 
 		 192 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  49.19 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  48.65 
 
 		 187 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  48.11 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.31 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  47.31 
 
 		 187 aa  174  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  45.11 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  41.51 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  46.52 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  42.45 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  41.51 
 
 		 217 aa  171  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  48.13 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  45.11 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  47.83 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.04 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.04 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  44.09 
 
 		 189 aa  168  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  41.31 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  47.57 
 
 		 183 aa  167  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  42.52 
 
 		 215 aa  167  7e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  43.24 
 
 		 374 aa  167  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  43.9 
 
 		 219 aa  167  8e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  40.38 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  43.32 
 
 		 194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  43.32 
 
 		 194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  40.57 
 
 		 215 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  40.76 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  39.15 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  41.15 
 
 		 217 aa  164  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  39.62 
 
 		 217 aa  164  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  39.91 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  40.57 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  46.67 
 
 		 184 aa  164  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  44.2 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  38.03 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  41.18 
 
 		 423 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  38.03 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  43.85 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  40.57 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  42.78 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  44.2 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  39.15 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  39.62 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  38.97 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  41.15 
 
 		 217 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  42.16 
 
 		 367 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  43.46 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  39.82 
 
 		 225 aa  161  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  40.64 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  39.91 
 
 		 214 aa  160  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  39.25 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  40.38 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  39.62 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  43.46 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  44.92 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  36.62 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  41.06 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  38.68 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  40.69 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0079  adenylate kinase  41.35 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000187867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  38.21 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  41.62 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  41.67 
 
 		 205 aa  157  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  42.71 
 
 		 367 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  39.44 
 
 		 228 aa  156  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  40.69 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2134  adenylate kinase  43.27 
 
 		 208 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  40.67 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  40.69 
 
 		 217 aa  154  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  42.78 
 
 		 309 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  41.15 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  42.78 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  40.57 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>