More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1148 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  100 
 
 
181 aa  355  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  61.45 
 
 
181 aa  225  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  58.89 
 
 
184 aa  216  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  59.22 
 
 
184 aa  213  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  55.25 
 
 
187 aa  200  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  54.19 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  54.7 
 
 
181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  54.14 
 
 
181 aa  193  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  54.14 
 
 
181 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  54.14 
 
 
181 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  54.14 
 
 
181 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  53.76 
 
 
186 aa  190  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  57.3 
 
 
191 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  52.33 
 
 
193 aa  185  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  53.51 
 
 
186 aa  184  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  48.65 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  44.13 
 
 
214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  44.6 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  44.6 
 
 
216 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  55.14 
 
 
201 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  50.56 
 
 
186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  54.59 
 
 
189 aa  181  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  45.97 
 
 
215 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  49.06 
 
 
217 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  54.35 
 
 
192 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  51.58 
 
 
204 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  49.76 
 
 
216 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  53.26 
 
 
205 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  48.62 
 
 
184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  47.2 
 
 
217 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  44.6 
 
 
217 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  48.11 
 
 
217 aa  175  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  47.12 
 
 
213 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  46.99 
 
 
191 aa  175  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  49.06 
 
 
217 aa  175  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  50.8 
 
 
367 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  51.63 
 
 
192 aa  174  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  52.17 
 
 
192 aa  173  9e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  47.66 
 
 
217 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  47.64 
 
 
217 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  47.17 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  44.6 
 
 
215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.85 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  47.85 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  52.72 
 
 
211 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  47.03 
 
 
367 aa  171  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  44.2 
 
 
185 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  48.88 
 
 
184 aa  171  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  51.67 
 
 
197 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  46.73 
 
 
217 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  49.17 
 
 
186 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  44.34 
 
 
214 aa  168  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  47.8 
 
 
182 aa  168  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  43.66 
 
 
217 aa  168  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  44.86 
 
 
214 aa  168  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  47.09 
 
 
205 aa  167  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  47.66 
 
 
217 aa  167  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  40.72 
 
 
218 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  47.4 
 
 
360 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  47.57 
 
 
191 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  43.64 
 
 
225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0216  adenylate kinase  48.35 
 
 
187 aa  164  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  48.17 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  46.94 
 
 
341 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  40.85 
 
 
217 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  41.23 
 
 
215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  44.6 
 
 
216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  45.56 
 
 
183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  47.4 
 
 
199 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  48.09 
 
 
200 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  44.39 
 
 
217 aa  161  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  43.4 
 
 
213 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  43.66 
 
 
216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  45.28 
 
 
219 aa  160  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37399  predicted protein  40.45 
 
 
239 aa  161  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.889133  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  48.52 
 
 
195 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  42.06 
 
 
215 aa  160  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  46.63 
 
 
194 aa  160  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  46.6 
 
 
194 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.31 
 
 
226 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  46.6 
 
 
208 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  44.89 
 
 
187 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  42.06 
 
 
215 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  42.06 
 
 
215 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  46.07 
 
 
194 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  48.4 
 
 
195 aa  159  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  43.13 
 
 
215 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  46.07 
 
 
194 aa  158  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  47.06 
 
 
309 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  49.21 
 
 
205 aa  158  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  41.78 
 
 
213 aa  158  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  42.92 
 
 
214 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  48.91 
 
 
193 aa  157  6e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.75 
 
 
215 aa  157  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  43.01 
 
 
190 aa  157  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  46.6 
 
 
206 aa  157  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  46.74 
 
 
192 aa  157  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  45.83 
 
 
192 aa  157  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  44.34 
 
 
213 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.14 
 
 
211 aa  156  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>