More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6459 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  57.67 
 
 
218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  50.7 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  52.05 
 
 
216 aa  210  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  52.29 
 
 
215 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  51.67 
 
 
211 aa  209  3e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  48.39 
 
 
217 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  208  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  48.83 
 
 
213 aa  206  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  48.15 
 
 
214 aa  206  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  51.38 
 
 
214 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  46.48 
 
 
216 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  46.48 
 
 
216 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  206  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  49.54 
 
 
215 aa  205  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  51.83 
 
 
234 aa  205  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  49.54 
 
 
215 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  49.53 
 
 
215 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  51.83 
 
 
214 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  51.83 
 
 
214 aa  204  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  51.83 
 
 
214 aa  204  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  51.83 
 
 
214 aa  204  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  51.83 
 
 
214 aa  204  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  51.83 
 
 
214 aa  204  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  51.83 
 
 
214 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  51.83 
 
 
214 aa  204  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  50.92 
 
 
214 aa  204  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  51.38 
 
 
214 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  51.38 
 
 
214 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  49.08 
 
 
214 aa  203  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  51.38 
 
 
214 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  51.38 
 
 
214 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  51.38 
 
 
214 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.37 
 
 
216 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  50.46 
 
 
215 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  50.71 
 
 
216 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  49.75 
 
 
213 aa  201  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  50.68 
 
 
216 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  50.68 
 
 
216 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  49.09 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  49.24 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  48.18 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  49.53 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  48.18 
 
 
218 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  49.54 
 
 
214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  50.94 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  47.27 
 
 
218 aa  199  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  49.09 
 
 
217 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  48.39 
 
 
217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  47.89 
 
 
216 aa  198  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  46.23 
 
 
215 aa  198  6e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  49.77 
 
 
216 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1739  adenylate kinases  47.95 
 
 
218 aa  197  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000022686  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  49.77 
 
 
216 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  47.73 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  48.11 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  47.73 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  53.23 
 
 
218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  48.36 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  48.11 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.23 
 
 
226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  49.08 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1557  adenylate kinase  47.49 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000621346  normal  0.163414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  47.51 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  48.17 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  49.09 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  47.09 
 
 
220 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.6 
 
 
226 aa  195  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  47.09 
 
 
220 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  47.09 
 
 
220 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2134  adenylate kinase  50.24 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104545  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  46.85 
 
 
218 aa  195  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  49.3 
 
 
219 aa  194  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2039  Adenylate kinase  47.89 
 
 
214 aa  194  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  47.3 
 
 
218 aa  194  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.64 
 
 
214 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  46.64 
 
 
220 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  46.61 
 
 
222 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.75 
 
 
218 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  44.39 
 
 
214 aa  193  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  45.16 
 
 
217 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  46.48 
 
 
214 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  46.19 
 
 
220 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  46.7 
 
 
213 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  48.08 
 
 
217 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  46.64 
 
 
220 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  46.64 
 
 
220 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  45.07 
 
 
217 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  45.54 
 
 
221 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1954  Adenylate kinase  47.42 
 
 
214 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  47.06 
 
 
218 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  45.74 
 
 
220 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  47.47 
 
 
214 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  45.91 
 
 
218 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>