More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1557 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1557  adenylate kinase  100 
 
 
218 aa  443  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000621346  normal  0.163414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1739  adenylate kinases  97.24 
 
 
218 aa  432  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000022686  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  80.18 
 
 
218 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  64.06 
 
 
218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  65.44 
 
 
217 aa  299  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  64.65 
 
 
215 aa  295  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  63.59 
 
 
218 aa  291  5e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  67.13 
 
 
214 aa  289  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  67.13 
 
 
214 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  67.13 
 
 
214 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  67.13 
 
 
214 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  67.13 
 
 
214 aa  288  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  66.67 
 
 
214 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  66.51 
 
 
214 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  61.47 
 
 
218 aa  284  7e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  60.83 
 
 
219 aa  284  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  66.2 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  66.2 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  66.2 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  61.01 
 
 
219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  65.74 
 
 
214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  62.5 
 
 
215 aa  281  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  62.5 
 
 
215 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  60.55 
 
 
218 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  65.58 
 
 
214 aa  280  9e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  64.65 
 
 
214 aa  279  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  61.29 
 
 
218 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  61.01 
 
 
218 aa  279  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  66.35 
 
 
214 aa  280  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  60.47 
 
 
216 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  60.47 
 
 
216 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  65.12 
 
 
214 aa  278  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  60 
 
 
216 aa  277  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  60 
 
 
216 aa  277  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  62.56 
 
 
214 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  62.56 
 
 
214 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  62.56 
 
 
214 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  62.56 
 
 
214 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  62.56 
 
 
214 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  61.86 
 
 
215 aa  277  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  59.53 
 
 
215 aa  274  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  60.19 
 
 
215 aa  274  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  60.09 
 
 
218 aa  274  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  58.6 
 
 
216 aa  274  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  60.09 
 
 
218 aa  274  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  57.47 
 
 
221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  61.57 
 
 
215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  59.63 
 
 
218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  60.93 
 
 
214 aa  272  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  58.37 
 
 
222 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  63.26 
 
 
227 aa  272  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  60.93 
 
 
215 aa  272  3e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  57.47 
 
 
221 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3900  adenylate kinase  61.4 
 
 
214 aa  271  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  57.92 
 
 
222 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  59.01 
 
 
221 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  60.19 
 
 
218 aa  270  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  62.02 
 
 
234 aa  270  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  58.82 
 
 
221 aa  270  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1168  adenylate kinase  56.88 
 
 
218 aa  270  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.949155  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  62.02 
 
 
214 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  62.02 
 
 
214 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  62.02 
 
 
214 aa  270  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  62.02 
 
 
214 aa  270  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  62.02 
 
 
214 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  62.02 
 
 
214 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  62.02 
 
 
214 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  60.47 
 
 
214 aa  269  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  62.02 
 
 
214 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  58.33 
 
 
218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  60.19 
 
 
214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  59.53 
 
 
214 aa  268  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  59.45 
 
 
217 aa  267  8.999999999999999e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0309  adenylate kinase  57.92 
 
 
221 aa  266  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  58.99 
 
 
217 aa  266  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  60.93 
 
 
214 aa  267  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1541  adenylate kinase  55.5 
 
 
218 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0259287  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  57.21 
 
 
222 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  56.56 
 
 
221 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  60 
 
 
214 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  58.14 
 
 
214 aa  265  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  60.65 
 
 
218 aa  265  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1416  adenylate kinase  57.8 
 
 
219 aa  264  7e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  58.8 
 
 
217 aa  264  8e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  57.01 
 
 
221 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  60.47 
 
 
214 aa  263  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  60.19 
 
 
218 aa  263  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  60.47 
 
 
214 aa  263  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  60 
 
 
214 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  58.14 
 
 
214 aa  263  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  60 
 
 
214 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  58.18 
 
 
220 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  60.47 
 
 
214 aa  261  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0648  adenylate kinase  60.19 
 
 
214 aa  260  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0373092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  57.73 
 
 
220 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  57.87 
 
 
217 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  58.33 
 
 
218 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  56.36 
 
 
220 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  57.67 
 
 
214 aa  258  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  57.67 
 
 
214 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>