More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2018 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  100 
 
 		 214 aa  433  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  99.07 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  99.07 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  99.07 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  98.13 
 
 		 214 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  97.2 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  97.2 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  97.2 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  97.2 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  93.93 
 
 		 214 aa  410  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  93.43 
 
 		 214 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  92.02 
 
 		 214 aa  401  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  90.14 
 
 		 214 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  89.67 
 
 		 214 aa  394  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  88.26 
 
 		 227 aa  393  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  88.26 
 
 		 214 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0373  adenylate kinase  82.52 
 
 		 220 aa  353  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  76.06 
 
 		 214 aa  343  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  76.53 
 
 		 214 aa  339  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  76.53 
 
 		 214 aa  338  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  75.59 
 
 		 214 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3900  adenylate kinase  74.65 
 
 		 214 aa  336  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  75.59 
 
 		 214 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  75.59 
 
 		 214 aa  333  1e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  75.59 
 
 		 214 aa  333  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  75.12 
 
 		 214 aa  332  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  74.65 
 
 		 214 aa  330  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  73.24 
 
 		 214 aa  327  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  73.71 
 
 		 214 aa  327  8e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  73.24 
 
 		 214 aa  327  8e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  74.18 
 
 		 214 aa  322  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  73.24 
 
 		 214 aa  320  9.000000000000001e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  73.24 
 
 		 214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  73.24 
 
 		 214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  73.24 
 
 		 214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  73.24 
 
 		 214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  73.24 
 
 		 214 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  72.3 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  70.83 
 
 		 222 aa  316  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  72.3 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  72.3 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  72.3 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  72.3 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  72.3 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0815  adenylate kinase  72.43 
 
 		 215 aa  316  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  72.3 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  72.3 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  72.3 
 
 		 214 aa  316  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  71.36 
 
 		 214 aa  315  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0648  adenylate kinase  70.89 
 
 		 214 aa  315  5e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0373092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  70.7 
 
 		 216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  70.7 
 
 		 216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  67.61 
 
 		 214 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  70.23 
 
 		 216 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  70.23 
 
 		 216 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  69.12 
 
 		 217 aa  304  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  68.66 
 
 		 218 aa  304  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  68.52 
 
 		 218 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  68.52 
 
 		 218 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  68.66 
 
 		 218 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  71.01 
 
 		 218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  68.98 
 
 		 218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  69.44 
 
 		 218 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  67.76 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  67.29 
 
 		 215 aa  299  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  68.22 
 
 		 215 aa  298  3e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  66.82 
 
 		 218 aa  297  9e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  68.22 
 
 		 215 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  66.05 
 
 		 216 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  67.28 
 
 		 219 aa  296  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  66.06 
 
 		 221 aa  295  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  66.82 
 
 		 215 aa  294  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  66.2 
 
 		 217 aa  293  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  69.44 
 
 		 217 aa  293  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  68.2 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  67.59 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  67.59 
 
 		 218 aa  292  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  66.36 
 
 		 220 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  66.36 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  64.71 
 
 		 221 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  64.71 
 
 		 221 aa  290  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  66.2 
 
 		 218 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  65.91 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  65.91 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  65.91 
 
 		 220 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  64.71 
 
 		 221 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  66.36 
 
 		 220 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  66.82 
 
 		 215 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  68.06 
 
 		 217 aa  289  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  66.36 
 
 		 220 aa  289  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  65 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  65 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  65 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  65 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  65 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  65 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  65 
 
 		 220 aa  288  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  64.81 
 
 		 218 aa  288  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  65 
 
 		 220 aa  288  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  76.37 
 
 		 218 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>