More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0648 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0648  adenylate kinase  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0667  adenylate kinase  80.42 
 
 
192 aa  310  7.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.289551  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0742  adenylate kinase  79.37 
 
 
192 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1360  adenylate kinase  79.37 
 
 
192 aa  308  4e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.228682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1197  adenylate kinase  76.32 
 
 
191 aa  290  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0466  adenylate kinase  72.87 
 
 
188 aa  281  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.031202  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1980  adenylate kinase  69.84 
 
 
189 aa  275  4e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.110196  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0295  adenylate kinase  68.11 
 
 
192 aa  255  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0652  adenylate kinase  66.67 
 
 
190 aa  251  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0325031  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1087  adenylate kinase  63.78 
 
 
189 aa  244  8e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  33.87 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  38.71 
 
 
185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  35.59 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0216  adenylate kinase  33.86 
 
 
187 aa  112  3e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  31.6 
 
 
213 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  33.88 
 
 
186 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  34.39 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  33.51 
 
 
367 aa  107  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1110  adenylate kinase  36.87 
 
 
182 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  32.69 
 
 
213 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  32.99 
 
 
194 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19841  adenylate kinase  36.87 
 
 
182 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.966566  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  37.2 
 
 
181 aa  105  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  33.85 
 
 
194 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  33.85 
 
 
194 aa  105  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  33.9 
 
 
182 aa  104  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  34.18 
 
 
309 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  33.85 
 
 
194 aa  104  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  34.71 
 
 
187 aa  104  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40028  predicted protein  33.15 
 
 
210 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  31.22 
 
 
205 aa  102  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  31.38 
 
 
374 aa  101  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  37.34 
 
 
181 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  37.82 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  35.23 
 
 
189 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  31.87 
 
 
187 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  29.95 
 
 
216 aa  99.4  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  31.03 
 
 
217 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1398  adenylate kinase  29.58 
 
 
214 aa  99  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  33.53 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  28.27 
 
 
195 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  35 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17211  adenylate kinase  34.62 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  31.38 
 
 
190 aa  98.2  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  32.79 
 
 
193 aa  97.8  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1631  adenylate kinase  32.97 
 
 
182 aa  97.8  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  32.29 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  31.41 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  37.74 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  31.09 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  32.65 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  29.38 
 
 
360 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  37.74 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  29.68 
 
 
217 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  37.74 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3771  adenylate kinase  29.63 
 
 
222 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  32.24 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  31.09 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  34.81 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17461  adenylate kinase  33.51 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.520654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  27.44 
 
 
222 aa  95.9  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  32.14 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  28.57 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  30.43 
 
 
214 aa  95.5  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  31.69 
 
 
205 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  28.99 
 
 
217 aa  95.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  32.24 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  29.76 
 
 
217 aa  95.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  31.52 
 
 
367 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  29.79 
 
 
195 aa  95.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  33.15 
 
 
389 aa  94.7  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  30.29 
 
 
214 aa  94.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17301  adenylate kinase  32.79 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.853299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  31.44 
 
 
199 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  32.62 
 
 
192 aa  94  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  29.51 
 
 
184 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63834  Adenylate kinase 2 (mitochondrial GTP:AMP phosphotransferase)  29.3 
 
 
229 aa  94  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0949348  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  27.7 
 
 
224 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  29.38 
 
 
341 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  31.4 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  34.39 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  33.33 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2134  adenylate kinase  26.57 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104545  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  32 
 
 
202 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  30.84 
 
 
216 aa  92.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  31.74 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  32.26 
 
 
193 aa  92  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  29.19 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  30.37 
 
 
216 aa  92  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  29.33 
 
 
214 aa  91.7  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  33.96 
 
 
183 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  30.37 
 
 
216 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  30.37 
 
 
216 aa  91.3  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  30.37 
 
 
216 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  33.33 
 
 
201 aa  91.7  7e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  30.37 
 
 
216 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  32.07 
 
 
192 aa  91.3  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  34.81 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  30.37 
 
 
216 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  32.09 
 
 
190 aa  91.3  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>