49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6277 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  770    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  40.22 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2476  hypothetical protein  38.29 
 
 		 378 aa  252  8.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1257  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2134  hypothetical protein  39.54 
 
 		 378 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2600  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00645929  normal  0.0443804 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4864  metal-dependent phosphohydrolase  36.99 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4558  metal-dependent phosphohydrolase  35.47 
 
 		 381 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1514  polyA polymerase related protein  38.26 
 
 		 149 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112472  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2544  metal dependent phophohydrolase  37.5 
 
 		 215 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1673  HD domain-containing protein  33.93 
 
 		 218 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4118  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1650  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0335969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1930  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  32.73 
 
 		 852 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1254  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297559  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4022  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.46 
 
 		 557 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  27.35 
 
 		 852 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  28.15 
 
 		 870 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0396  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.48 
 
 		 456 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.220421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0218  polyA polymerase family protein  34.48 
 
 		 456 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0699  polynucleotide adenylyltransferase region  35.14 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  29.06 
 
 		 854 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  27.34 
 
 		 577 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  27.35 
 
 		 834 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  27.35 
 
 		 877 aa  49.7  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1206  HDIG domain-containing protein  31.62 
 
 		 198 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.593605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  29.91 
 
 		 859 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703829 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05751  DNA kinase/phosphatase (Eurofung)  23.08 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.396149  normal  0.010581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  28 
 
 		 852 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  25.64 
 
 		 847 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5796  putative kinase  25 
 
 		 148 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  25.97 
 
 		 335 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  26.5 
 
 		 857 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  26.19 
 
 		 155 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  26.5 
 
 		 847 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  26.5 
 
 		 858 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  26.53 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 830 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  26.5 
 
 		 863 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4267  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 181 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  25.64 
 
 		 853 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1107  metal dependent phosphohydrolase  31.78 
 
 		 202 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0949272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.42 
 
 		 483 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  25.64 
 
 		 870 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  29.13 
 
 		 137 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  24.65 
 
 		 264 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1469  tRNA nucleotidyltransferase  33.01 
 
 		 190 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>