44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2476 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2134  hypothetical protein  93.63 
 
 		 378 aa  744    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2476  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  786    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4864  metal-dependent phosphohydrolase  66.58 
 
 		 377 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4558  metal-dependent phosphohydrolase  60.16 
 
 		 381 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1257  metal dependent phosphohydrolase  37.32 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  38.29 
 
 		 370 aa  252  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  38.83 
 
 		 378 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2600  metal dependent phosphohydrolase  39.07 
 
 		 384 aa  215  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00645929  normal  0.0443804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1514  polyA polymerase related protein  36.8 
 
 		 149 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1650  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0335969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1930  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.39 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4118  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.28 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0699  polynucleotide adenylyltransferase region  35.4 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2544  metal dependent phophohydrolase  27.27 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1673  HD domain-containing protein  26.74 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.01 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1254  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 459 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  30.99 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1107  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0949272 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0396  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.64 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.220421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0218  polyA polymerase family protein  38.64 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  30.37 
 
 		 155 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05390  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  26.36 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.59281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4022  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 557 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1469  tRNA nucleotidyltransferase  29.05 
 
 		 190 aa  49.7  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1008  metal dependent phosphohydrolase  30.13 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000394807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.44 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1084  metal dependent phosphohydrolase  27.33 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000542192  normal  0.0207195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1166  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.66 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000545015  hitchhiker  0.000309959 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  36.79 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2054  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0255886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.06 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1206  HDIG domain-containing protein  29.76 
 
 		 198 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.593605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  28.97 
 
 		 577 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2455  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4267  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 		 181 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 502 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0834  polynucleotide adenylyltransferase region  28.85 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000136333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 		 492 aa  43.1  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2979  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000079724  normal  0.0360054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  29.91 
 
 		 479 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2897  metal dependent phosphohydrolase  27.85 
 
 		 416 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000147778  hitchhiker  0.00074831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1115  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 420 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625307  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>