40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2600 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2600  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 384 aa  749    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00645929  normal  0.0443804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  52.88 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1257  metal dependent phosphohydrolase  38.36 
 
 		 376 aa  276  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  40.16 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4558  metal-dependent phosphohydrolase  43.47 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2476  hypothetical protein  39.62 
 
 		 378 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4864  metal-dependent phosphohydrolase  40.48 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2134  hypothetical protein  39.34 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1514  polyA polymerase related protein  43.75 
 
 		 149 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1650  metal dependent phosphohydrolase  32.74 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0335969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1254  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297559  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.23 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05390  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.76 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.59281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1673  HD domain-containing protein  30.73 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0699  polynucleotide adenylyltransferase region  40.59 
 
 		 463 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  39.6 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2544  metal dependent phophohydrolase  31.08 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  35.77 
 
 		 577 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 479 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1930  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.08 
 
 		 459 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4118  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.65 
 
 		 458 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  30.7 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1206  HDIG domain-containing protein  36.57 
 
 		 198 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.593605  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1469  tRNA nucleotidyltransferase  34.85 
 
 		 190 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4022  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351596 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  27.57 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  27.19 
 
 		 200 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  17.78 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1107  metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 		 202 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0949272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  37.5 
 
 		 548 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  28.42 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5573  metallophosphoesterase  39.64 
 
 		 161 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.29 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0806  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 		 247 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 454 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0218  polyA polymerase family protein  38.75 
 
 		 456 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0396  Polynucleotide adenylyltransferase region  38.75 
 
 		 456 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.220421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>