92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0806 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0806  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
247 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 
479 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  40.44 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  36.14 
 
 
475 aa  67  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.66 
 
 
483 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  34.9 
 
 
496 aa  65.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  33.85 
 
 
471 aa  65.5  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  34.92 
 
 
488 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.76 
 
 
561 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 
507 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0973  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 
474 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 
491 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
502 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 
426 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
502 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  34.93 
 
 
479 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26890  tRNA adenylyltransferase  38 
 
 
484 aa  60.1  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  36.42 
 
 
483 aa  59.7  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
492 aa  59.3  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.67 
 
 
502 aa  59.3  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
483 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.01 
 
 
500 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  33.14 
 
 
497 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  33.88 
 
 
483 aa  58.9  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
499 aa  58.5  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.92 
 
 
484 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 
483 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  33.1 
 
 
479 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  30.18 
 
 
474 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.68 
 
 
464 aa  56.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.16 
 
 
483 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0612  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
433 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 
486 aa  55.8  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 
490 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
489 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
489 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  34.39 
 
 
489 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 
455 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  35.29 
 
 
480 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 
471 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  26.17 
 
 
493 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 
552 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
508 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
487 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  33.9 
 
 
523 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  31.87 
 
 
476 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 
479 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.57 
 
 
464 aa  52.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1238  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
500 aa  52  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
462 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 
484 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.97 
 
 
473 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  36.6 
 
 
525 aa  50.8  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  28.98 
 
 
477 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  29.38 
 
 
483 aa  50.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.1 
 
 
468 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1592  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  24.19 
 
 
529 aa  49.7  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  33.33 
 
 
485 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0314  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
498 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000179563  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
489 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  33.76 
 
 
475 aa  49.3  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 
471 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2966  HD domain-containing protein  30.53 
 
 
440 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.359451  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.7 
 
 
469 aa  48.5  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0446  metal dependent phosphohydrolase  29.46 
 
 
443 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 
508 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  25.23 
 
 
501 aa  48.1  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.01 
 
 
475 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  27.54 
 
 
448 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  29.22 
 
 
470 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 
464 aa  47  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4558  metal-dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 
381 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354292  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0160  metal dependent phosphohydrolase  28.45 
 
 
194 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
485 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4267  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 
181 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.55 
 
 
427 aa  45.4  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0462  metal dependent phosphohydrolase  34.74 
 
 
442 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.317463  normal  0.166198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  35.4 
 
 
492 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0065  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  22.12 
 
 
467 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000449224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3067  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
489 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  hitchhiker  0.000000430788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1257  metal dependent phosphohydrolase  31.3 
 
 
376 aa  44.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0264  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 
517 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1650  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0335969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1799  putative RNA nucleotidyltransferase  28.57 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0158  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
472 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2600  metal dependent phosphohydrolase  38.14 
 
 
384 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00645929  normal  0.0443804 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1427  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 
441 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05390  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.52 
 
 
454 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.59281  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6813  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
330 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.602846  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 
450 aa  42.7  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 
583 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  24.86 
 
 
448 aa  42.7  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>