More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_26890  tRNA adenylyltransferase  100 
 
 
484 aa  964    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  64.94 
 
 
483 aa  593  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  64.05 
 
 
490 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  63.2 
 
 
488 aa  589  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  60.57 
 
 
523 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  62.55 
 
 
491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  65.39 
 
 
507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  66.52 
 
 
508 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  62 
 
 
500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  67.25 
 
 
483 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  61.82 
 
 
496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  62.84 
 
 
483 aa  571  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  62.26 
 
 
499 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  62.47 
 
 
479 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  61.17 
 
 
502 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  59.5 
 
 
486 aa  558  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  61.29 
 
 
492 aa  558  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  60.7 
 
 
487 aa  552  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  60.09 
 
 
502 aa  551  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  61.73 
 
 
483 aa  552  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  60.47 
 
 
497 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  61.64 
 
 
552 aa  550  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  60.43 
 
 
489 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  59.91 
 
 
471 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  59.61 
 
 
483 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  57.94 
 
 
475 aa  536  1e-151  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  58.46 
 
 
471 aa  535  1e-151  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  58.92 
 
 
480 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  58.26 
 
 
485 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  60.21 
 
 
525 aa  528  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.86 
 
 
485 aa  523  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.73 
 
 
464 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  58.03 
 
 
489 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  58.03 
 
 
489 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  58.61 
 
 
455 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  55.46 
 
 
502 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.11 
 
 
473 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  54.83 
 
 
508 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  45.44 
 
 
462 aa  354  2e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.16 
 
 
484 aa  294  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.82 
 
 
489 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  38.66 
 
 
510 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.93 
 
 
471 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.27 
 
 
483 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 
475 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  35.7 
 
 
474 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.92 
 
 
561 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.02 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.07 
 
 
479 aa  243  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  35.84 
 
 
470 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.67 
 
 
484 aa  240  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.4 
 
 
468 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  35.55 
 
 
475 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  37.28 
 
 
483 aa  234  3e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  34.8 
 
 
479 aa  232  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  32.91 
 
 
476 aa  230  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  33.93 
 
 
448 aa  226  7e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 
469 aa  226  7e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  33.05 
 
 
477 aa  226  9e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 
495 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.77 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.75 
 
 
448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
450 aa  187  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 
464 aa  186  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.87 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 
459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.68 
 
 
473 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  30.58 
 
 
454 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  31.11 
 
 
442 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  29.69 
 
 
437 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  33.25 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  32.82 
 
 
451 aa  163  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.35 
 
 
583 aa  156  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.44 
 
 
427 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  32.52 
 
 
422 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 
492 aa  155  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.56 
 
 
479 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.31 
 
 
584 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  28.35 
 
 
424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.17 
 
 
467 aa  144  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.43 
 
 
403 aa  143  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.18 
 
 
401 aa  134  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1238  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 
500 aa  133  6e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  30.82 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0908  tRNA CCA-pyrophosphorylase  35.29 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  35.16 
 
 
394 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
426 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  31.88 
 
 
471 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.16 
 
 
404 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1027  tRNA CCA-pyrophosphorylase  32.1 
 
 
400 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1653  tRNA CCA-pyrophosphorylase  36.05 
 
 
402 aa  123  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  31.91 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.94 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0612  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
433 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_276  polymerase  27.27 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000457601  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  32.16 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0334  polyA polymerase family protein  27.47 
 
 
493 aa  118  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000707313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6813  metal dependent phosphohydrolase  32.44 
 
 
330 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.602846  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3090  metal dependent phosphohydrolase  27.29 
 
 
440 aa  117  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  29.72 
 
 
436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>