33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4558 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4558  metal-dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 381 aa  774    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2134  hypothetical protein  61.66 
 
 		 378 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4864  metal-dependent phosphohydrolase  66.58 
 
 		 377 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2476  hypothetical protein  60.16 
 
 		 378 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  43.44 
 
 		 378 aa  265  8.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1257  metal dependent phosphohydrolase  35.39 
 
 		 376 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2600  metal dependent phosphohydrolase  43.47 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00645929  normal  0.0443804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  35.47 
 
 		 370 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1514  polyA polymerase related protein  36.72 
 
 		 149 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112472  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1930  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.35 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4118  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  39.42 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0699  polynucleotide adenylyltransferase region  39.25 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1650  metal dependent phosphohydrolase  32.77 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0335969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1254  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  30.6 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297559  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4022  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.55 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351596 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0218  polyA polymerase family protein  34.84 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0396  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.84 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.220421 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.53 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  36.23 
 
 		 577 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05390  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  40 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.59281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2544  metal dependent phophohydrolase  30.72 
 
 		 215 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1673  HD domain-containing protein  30.19 
 
 		 218 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37 
 
 		 473 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1206  HDIG domain-containing protein  33.33 
 
 		 198 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.593605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1107  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 202 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0949272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4267  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 		 181 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0158  metal dependent phosphohydrolase  29.34 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  37 
 
 		 490 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0806  metal dependent phosphohydrolase  37.01 
 
 		 247 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  33.87 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1469  tRNA nucleotidyltransferase  33.73 
 
 		 190 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 502 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 		 454 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>