33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2134 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2134  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  781    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2476  hypothetical protein  93.63 
 
 		 378 aa  744    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4864  metal-dependent phosphohydrolase  68.44 
 
 		 377 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4558  metal-dependent phosphohydrolase  61.66 
 
 		 381 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  40.78 
 
 		 378 aa  252  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1257  metal dependent phosphohydrolase  37.61 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  39.54 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2600  metal dependent phosphohydrolase  38.8 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00645929  normal  0.0443804 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1514  polyA polymerase related protein  38.4 
 
 		 149 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1650  metal dependent phosphohydrolase  31.38 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0335969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1930  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0699  polynucleotide adenylyltransferase region  35.71 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4118  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.73 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1254  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  27.84 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1673  HD domain-containing protein  26.16 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2544  metal dependent phophohydrolase  25.97 
 
 		 215 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4022  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.94 
 
 		 557 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1107  metal dependent phosphohydrolase  28.1 
 
 		 202 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0949272 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33 
 
 		 464 aa  53.1  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0396  Polynucleotide adenylyltransferase region  40.74 
 
 		 456 aa  53.1  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.220421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0218  polyA polymerase family protein  40.74 
 
 		 456 aa  53.1  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05390  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  27.43 
 
 		 454 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.59281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1469  tRNA nucleotidyltransferase  28.34 
 
 		 190 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.32 
 
 		 427 aa  49.7  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  28.89 
 
 		 155 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  29.2 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0160  metal dependent phosphohydrolase  35.11 
 
 		 194 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1206  HDIG domain-containing protein  27.84 
 
 		 198 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.593605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.06 
 
 		 454 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1166  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000545015  hitchhiker  0.000309959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1084  metal dependent phosphohydrolase  26.71 
 
 		 413 aa  43.5  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000542192  normal  0.0207195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 490 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>