33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7067 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  100 
 
 
577 aa  1159    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  53.37 
 
 
548 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  47.74 
 
 
202 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0509237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  46.04 
 
 
207 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3222  hypothetical protein  46.93 
 
 
185 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.975216  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  28.94 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  32.24 
 
 
274 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  26.92 
 
 
294 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  33.61 
 
 
261 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  32.12 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  29.39 
 
 
232 aa  55.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  28.7 
 
 
235 aa  52  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  30.67 
 
 
241 aa  52  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  29.34 
 
 
230 aa  51.2  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  27.41 
 
 
717 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  27.04 
 
 
269 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  27.34 
 
 
370 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  30.33 
 
 
289 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4558  metal-dependent phosphohydrolase  36.23 
 
 
381 aa  48.9  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354292  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  33.56 
 
 
509 aa  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2600  metal dependent phosphohydrolase  35.77 
 
 
384 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00645929  normal  0.0443804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3463  carbohydrate kinase  30.14 
 
 
180 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3525  gluconate kinase  28.49 
 
 
184 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263705  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  26.13 
 
 
522 aa  46.2  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3661  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  29.66 
 
 
190 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.274585 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  40.74 
 
 
137 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  21.8 
 
 
260 aa  44.7  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2476  hypothetical protein  28.97 
 
 
378 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2454  hypothetical protein  28.91 
 
 
238 aa  43.9  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000820682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3771  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  28.77 
 
 
180 aa  43.9  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
859 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  30.66 
 
 
155 aa  43.5  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>