17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1600 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  51.67 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  56.27 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  52.31 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  52.69 
 
 		 294 aa  279  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  59.45 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  49.23 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  29.53 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  28.85 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  31.91 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  29.8 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  28.08 
 
 		 548 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  32.24 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  25.95 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  26.58 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0509237 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2454  hypothetical protein  29.46 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000820682  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3222  hypothetical protein  29.56 
 
 		 185 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.975216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>