21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0826 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  69.74 
 
 		 232 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  61.67 
 
 		 230 aa  297  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  55.16 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  37.15 
 
 		 284 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  35.43 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  33.86 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  38.49 
 
 		 289 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  35.74 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  29.53 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  28.02 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  31.05 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  28.7 
 
 		 577 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  28.84 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2898  RNA ligase, DRB0094 family  28.57 
 
 		 336 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2454  hypothetical protein  30.18 
 
 		 238 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000820682  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3222  hypothetical protein  27 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.975216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0323  hypothetical protein  29.81 
 
 		 178 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  26.58 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0509237 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3915  hypothetical protein  27.57 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1442  ATP dependent DNA ligase  29.89 
 
 		 373 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>