17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3737 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  61.78 
 
 		 232 aa  301  6.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  61.67 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  51.11 
 
 		 241 aa  224  6e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  34.11 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  34.12 
 
 		 307 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  33.88 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  32.13 
 
 		 261 aa  98.2  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  29.8 
 
 		 274 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  29.58 
 
 		 548 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  29.34 
 
 		 577 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3915  hypothetical protein  29.44 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  26.75 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2898  RNA ligase, DRB0094 family  28.36 
 
 		 336 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0323  hypothetical protein  29.38 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>