17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4559 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  58.76 
 
 		 294 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  57.82 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  57.82 
 
 		 289 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  56.27 
 
 		 274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  54.02 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  45.35 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  37.15 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  34.23 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  34.11 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  31.42 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  28.94 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  28.12 
 
 		 548 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2454  hypothetical protein  29.76 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000820682  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3222  hypothetical protein  29.75 
 
 		 185 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.975216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  31.25 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  27.42 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0509237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>