16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2133 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  608  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  94.56 
 
 		 307 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  60.22 
 
 		 289 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  58.76 
 
 		 284 aa  325  8.000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  52.69 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  47.86 
 
 		 261 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  44.03 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  33.86 
 
 		 235 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  33.33 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  32.42 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  30.74 
 
 		 241 aa  91.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  26.92 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  31.41 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2454  hypothetical protein  30.25 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000820682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  25.38 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0323  hypothetical protein  29.13 
 
 		 178 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>