16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1871 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  54.91 
 
 		 232 aa  248  5e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  55.16 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  51.11 
 
 		 230 aa  224  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  31.91 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  32.81 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  30.74 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  30.74 
 
 		 307 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  31.42 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  28.19 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  31.4 
 
 		 289 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  28 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  27.01 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0509237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  30.67 
 
 		 577 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2898  RNA ligase, DRB0094 family  26.88 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  26.41 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>