17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2675 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3222  hypothetical protein  69.78 
 
 
185 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.975216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  46.04 
 
 
577 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  45.32 
 
 
548 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  42 
 
 
202 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0509237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  26.58 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  29.57 
 
 
261 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  25.95 
 
 
274 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  31.25 
 
 
284 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  28.84 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  29.46 
 
 
269 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  26.75 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  25.38 
 
 
294 aa  45.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  29.92 
 
 
307 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  26.41 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  29.11 
 
 
289 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2454  hypothetical protein  26.58 
 
 
238 aa  41.2  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000820682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>