37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3032 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  100 
 
 		 548 aa  1067    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  53.37 
 
 		 577 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  51.74 
 
 		 202 aa  220  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0509237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  45.32 
 
 		 207 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3222  hypothetical protein  46.93 
 
 		 185 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.975216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  28.12 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  27.99 
 
 		 274 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  27.03 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  31.05 
 
 		 235 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  28 
 
 		 241 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  31.41 
 
 		 294 aa  57  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  29.58 
 
 		 230 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  29.72 
 
 		 232 aa  54.3  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  27.91 
 
 		 289 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  36.3 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  31.11 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  35.04 
 
 		 852 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  31.93 
 
 		 850 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  37.6 
 
 		 852 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  35.11 
 
 		 870 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  34.19 
 
 		 854 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  31.09 
 
 		 847 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  36.21 
 
 		 834 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  31.09 
 
 		 870 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  45.33 
 
 		 137 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  35 
 
 		 853 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  32.33 
 
 		 378 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  22.31 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  26.53 
 
 		 370 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  35.21 
 
 		 520 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  31.33 
 
 		 847 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  40.43 
 
 		 447 aa  45.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5573  metallophosphoesterase  35.71 
 
 		 161 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  38.79 
 
 		 877 aa  44.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  33.33 
 
 		 847 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 859 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703829 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>