14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1256 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  100 
 
 
269 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  51.67 
 
 
274 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  45.63 
 
 
261 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  45.35 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  44.03 
 
 
294 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  44.32 
 
 
307 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  42.59 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  28.02 
 
 
235 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  33.88 
 
 
230 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  28.4 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  28.19 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  26.71 
 
 
577 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  29.46 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  22.31 
 
 
548 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>