18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3690 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3690  DNA ligase III-like protein  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0826  DNA ligase III-like protein  69.74 
 
 		 235 aa  325  4.0000000000000003e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.771105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3737  DNA ligase III-like protein  61.78 
 
 		 230 aa  301  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405844 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1871  DNA ligase III-like  54.91 
 
 		 241 aa  248  5e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4559  DNA ligase III-like protein  34.23 
 
 		 284 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4863  hypothetical protein  34.32 
 
 		 289 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2133  hypothetical protein  32.42 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2475  hypothetical protein  32.16 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1600  hypothetical protein  28.85 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2599  hypothetical protein  31.6 
 
 		 261 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000426908  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1256  DNA ligase III  28.4 
 
 		 269 aa  96.3  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2675  hypothetical protein  26.58 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  29.39 
 
 		 577 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  29.72 
 
 		 548 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2898  RNA ligase, DRB0094 family  27.05 
 
 		 336 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3222  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.975216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2863  hypothetical protein  25.23 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0509237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1442  ATP dependent DNA ligase  30.54 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>