34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5573 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5573  metallophosphoesterase  100 
 
 
161 aa  317  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  32.91 
 
 
870 aa  65.1  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
850 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  33.54 
 
 
834 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  35.76 
 
 
852 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  31.13 
 
 
858 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14600  predicted kinase  35.03 
 
 
166 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0408324  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  37.7 
 
 
447 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  33.54 
 
 
847 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  27.22 
 
 
448 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5366  hypothetical protein  32.05 
 
 
713 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  31.41 
 
 
183 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  29.8 
 
 
847 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  31.82 
 
 
830 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  34.44 
 
 
877 aa  54.3  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  31.62 
 
 
859 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  32.43 
 
 
853 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  29.8 
 
 
870 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  36.54 
 
 
857 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  34.81 
 
 
864 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  36.3 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
863 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
854 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  26.27 
 
 
370 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  34.81 
 
 
484 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3032  kinase-like protein  36.28 
 
 
548 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.975135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  36.75 
 
 
847 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2600  metal dependent phosphohydrolase  43.33 
 
 
384 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00645929  normal  0.0443804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
852 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  36.89 
 
 
852 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7067  kinase-like protein  34.19 
 
 
577 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106105  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  30.97 
 
 
852 aa  41.2  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  28.67 
 
 
717 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>