More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7079 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  74.36 
 
 
523 aa  699    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
502 aa  1003    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4223  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  70.69 
 
 
486 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  69.68 
 
 
464 aa  637    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4840  tRNA adenylyltransferase  70.07 
 
 
489 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.305864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0845  metal dependent phosphohydrolase  68.7 
 
 
497 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0325439  normal  0.188962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13942  poly(A) polymerase pcnA  68.27 
 
 
480 aa  614  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00346461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5773  metal dependent phosphohydrolase  69.98 
 
 
489 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.626419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5486  metal dependent phosphohydrolase  69.98 
 
 
489 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.527547  normal  0.550288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5397  metal dependent phosphohydrolase  70.77 
 
 
455 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.517114  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6061  metal dependent phosphohydrolase  66.81 
 
 
483 aa  599  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5079  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  65.74 
 
 
487 aa  580  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  63.5 
 
 
491 aa  580  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  60.94 
 
 
490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  61.29 
 
 
485 aa  561  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  62.5 
 
 
483 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  60.22 
 
 
485 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9369  hypothetical protein  60.78 
 
 
479 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26890  tRNA adenylyltransferase  60.09 
 
 
484 aa  552  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  58.64 
 
 
473 aa  542  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  60.13 
 
 
499 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4207  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  60.79 
 
 
483 aa  539  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4681  HDIG domain-containing protein  61.4 
 
 
483 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  59.35 
 
 
552 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4531  metal dependent phosphohydrolase  56.67 
 
 
502 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3362  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.14 
 
 
500 aa  521  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  57.33 
 
 
502 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  59.18 
 
 
488 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7321  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  56.9 
 
 
508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  57.11 
 
 
496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  60.13 
 
 
483 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3712  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  58.49 
 
 
507 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353872  normal  0.0967324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31840  tRNA adenylyltransferase  58.13 
 
 
471 aa  510  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  55.72 
 
 
471 aa  502  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  55.72 
 
 
492 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4494  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  60.88 
 
 
508 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0150465  normal  0.139356 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  54.43 
 
 
475 aa  491  1e-137  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2139  metal dependent phosphohydrolase  55.42 
 
 
525 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  49.89 
 
 
462 aa  381  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  42.02 
 
 
484 aa  316  8e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  37.17 
 
 
510 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1306  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38 
 
 
489 aa  256  5e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0992  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 
471 aa  256  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.07 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  37.47 
 
 
476 aa  244  3e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2544  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.66 
 
 
561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.62 
 
 
471 aa  240  4e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1151  polyA polymerase family protein  36.3 
 
 
475 aa  240  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.71029 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1109  metal dependent phosphohydrolase  36.78 
 
 
470 aa  238  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.875974  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 
464 aa  236  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.43 
 
 
484 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5957  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
483 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1525  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.24 
 
 
475 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  34.83 
 
 
477 aa  230  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.73 
 
 
469 aa  230  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.03 
 
 
468 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 
450 aa  226  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2535  tRNA adenylyltransferase (tRNA nucleotidyl transferase)  35.6 
 
 
479 aa  226  7e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  35.68 
 
 
448 aa  226  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0872  hypothetical protein  33.68 
 
 
474 aa  223  7e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4906  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.17 
 
 
495 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0801  polyA polymerase family protein  35.59 
 
 
483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
464 aa  202  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.61 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.83 
 
 
473 aa  191  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 
465 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.59 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 
442 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.88 
 
 
459 aa  178  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  31.82 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.71 
 
 
427 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  33.41 
 
 
434 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.44 
 
 
584 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
583 aa  160  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  32.22 
 
 
490 aa  159  8e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  28.94 
 
 
437 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1889  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 
479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  30.57 
 
 
467 aa  154  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  33.48 
 
 
471 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  40.91 
 
 
404 aa  143  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  27.64 
 
 
422 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  27.19 
 
 
424 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0499  tRNA CCA-pyrophosphorylase  41.36 
 
 
404 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  32.47 
 
 
436 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  35.09 
 
 
394 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6813  metal dependent phosphohydrolase  34.66 
 
 
330 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.602846  normal  0.654688 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0461  tRNA CCA-pyrophosphorylase  29.67 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2216  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.45 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0727  polynucleotide adenylyltransferase  34.65 
 
 
410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.43886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2393  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.58 
 
 
529 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  31.82 
 
 
436 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0767  tRNA CCA-pyrophosphorylase  38.6 
 
 
403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.746315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0756  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  37.02 
 
 
401 aa  130  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.525982  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0279  hypothetical protein  37.98 
 
 
549 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1260  tRNA CCA-pyrophosphorylase  37.74 
 
 
397 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0290  poly(A) polymerase  37.6 
 
 
556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0303  poly(A) polymerase  36.59 
 
 
548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.203958  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0301  poly(A) polymerase  37.6 
 
 
556 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0077  poly(A) polymerase family protein  33.9 
 
 
410 aa  125  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.991708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>