13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31360  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  822    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.559839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5491  putative phage polynucleotide kinase  35 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334649  normal  0.800954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2972  putative phage polynucleotide kinase  33.71 
 
 		 302 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  hitchhiker  0.000387567 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  30.46 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0633  Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase  32.12 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0439631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  28.29 
 
 		 264 aa  53.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1045  hypothetical protein  31.62 
 
 		 179 aa  53.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  27.81 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5366  hypothetical protein  34.35 
 
 		 713 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0664  putative kinase  30 
 
 		 480 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  32.59 
 
 		 155 aa  49.7  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  26.49 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  26.49 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.394826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>