48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0979 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  100 
 
 
178 aa  363  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  97.19 
 
 
178 aa  323  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  96.63 
 
 
178 aa  321  4e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  89.6 
 
 
174 aa  285  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  69.14 
 
 
178 aa  228  4e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  50.86 
 
 
175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  42.46 
 
 
191 aa  155  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  42.46 
 
 
191 aa  154  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  46.89 
 
 
177 aa  152  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  49.41 
 
 
179 aa  151  4e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  48.31 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  43.43 
 
 
192 aa  147  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  45.76 
 
 
172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  43.02 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  42.29 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  41.34 
 
 
178 aa  132  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  39.88 
 
 
184 aa  129  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  39.55 
 
 
181 aa  128  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  35.71 
 
 
184 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  35.63 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  36.9 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  37.5 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  36.87 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  40.34 
 
 
192 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  39.89 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  36.9 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  38.29 
 
 
180 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  35.29 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  31.11 
 
 
204 aa  98.2  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  36.07 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  30.97 
 
 
187 aa  87.4  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  24.19 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  27.01 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  25.28 
 
 
327 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  24.54 
 
 
251 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0782  nucleotide kinase  29.3 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1136  hypothetical protein  30.97 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  25 
 
 
218 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  36.51 
 
 
216 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_7072  predicted protein  47.62 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  28.28 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1398  adenylate kinase  51.35 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  40 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  25.5 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  25.79 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  33.33 
 
 
215 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  42.86 
 
 
212 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0311  adenylate kinase  39.06 
 
 
217 aa  41.2  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000173731  unclonable  2.3199200000000003e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>