90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1087 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1087  cytidylate kinase  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0849  cytidylate kinase  43.18 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1495  cytidylate kinase  41.86 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1364  cytidylate kinase  33.95 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.790143  normal  0.0224769 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0590  cytidylate kinase  32.48 
 
 		 181 aa  91.7  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0399  cytidylate kinase  38.46 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.185017  normal  0.222549 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0626  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 187 aa  90.5  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1703  cytidylate kinase  37.75 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.784294  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0118  cytidylate kinase  32.93 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000087822  hitchhiker  0.0000442728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0270  cytidylate kinase  32.34 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2255  cytidylate kinase  32.34 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1109  cytidylate kinase  32.72 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1729  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000578527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0558  cytidylate kinase  32.18 
 
 		 182 aa  85.9  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.818814  normal  0.184695 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2227  cytidylate kinase  31.29 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0027  cytidylate kinase  35.53 
 
 		 175 aa  85.1  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000301148  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1813  cytidylate kinase  31.74 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.147241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0898  cytidylate kinase  35.53 
 
 		 181 aa  84.7  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.136521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1127  cytidylate kinase  33.33 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.402231  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1734  cytidylate kinase  33.99 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2321  cytidylate kinase  31.58 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1751  cytidylate kinase  32.95 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0107  cytidylate kinase  32.39 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.233857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1945  cytidylate kinase  30.86 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1254  cytidylate kinase  31.07 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1499  cytidylate kinase  31.82 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0265  cytidylate kinase  30.3 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0979  cytidylate kinase  29.69 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1649  cytidylate kinase  29.55 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.73903  normal  0.997406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0083  cytidylate kinase  31.76 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0468  cytidylate kinase  31.25 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3839  cytidylate kinase-like protein  25.99 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.206028  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0405  cytidylate kinase  30.23 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  31.03 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1859  hypothetical protein  25.99 
 
 		 327 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  31.25 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  24.55 
 
 		 231 aa  51.2  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  25.45 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  31.84 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  31.84 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1866  hypothetical protein  25.99 
 
 		 327 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.546086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  24.32 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  23.2 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  27.4 
 
 		 227 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  23.87 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  27.14 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  23.42 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  23.42 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  23.42 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  23.42 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  23.42 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  23.42 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  23.42 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1620  cytidylate kinase  26.22 
 
 		 226 aa  45.8  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0731  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  25.57 
 
 		 315 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0737  cytidylate kinase  24.42 
 
 		 216 aa  44.7  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  27.68 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  25.69 
 
 		 219 aa  44.7  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf302  cytidylate kinase  24.34 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.245847  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00339  hypothetical protein  26.04 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0462  shikimate kinase II  26.04 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  23.64 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  22.83 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0418  shikimate kinase II  26.04 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3220  Shikimate kinase  26.04 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  27.62 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00335  shikimate kinase II  26.04 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0456  shikimate kinase II  26.04 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0305  shikimate kinase II  26.04 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3244  shikimate kinase II  26.04 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0812303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0415  shikimate kinase II  26.04 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1534  Shikimate kinase  26.86 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  24.14 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  24.71 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  27.68 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  24.72 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  28.18 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  22.97 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2172  nucleotide kinase-like protein  28.24 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000394872 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1220  shikimate kinase  24.73 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.455019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  25.71 
 
 		 174 aa  42.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  23.79 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  26.82 
 
 		 227 aa  42  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0780  cytidylate kinase  23.61 
 
 		 223 aa  42  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0405191  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  26.47 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0768  Shikimate kinase  26.88 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.694283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00510  shikimate kinase I  25.7 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  28.42 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  23.01 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  28.42 
 
 		 172 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>